Protein–RNA interactions for Protein: Q99MS8

Tpgs1, Tubulin polyglutamylase complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpgs1Q99MS8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpgs1Q99MS8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tpgs1Q99MS8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpgs1Q99MS8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpgs1Q99MS8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpgs1Q99MS8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tpgs1Q99MS8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tpgs1Q99MS8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tpgs1Q99MS8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpgs1Q99MS8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tpgs1Q99MS8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpgs1Q99MS8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Tpgs1Q99MS8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tpgs1Q99MS8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Tpgs1Q99MS8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpgs1Q99MS8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpgs1Q99MS8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tpgs1Q99MS8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Tpgs1Q99MS8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tpgs1Q99MS8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tpgs1Q99MS8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tpgs1Q99MS8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tpgs1Q99MS8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Tpgs1Q99MS8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpgs1Q99MS8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Tpgs1Q99MS8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Tpgs1Q99MS8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Tpgs1Q99MS8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Tpgs1Q99MS8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Tpgs1Q99MS8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpgs1Q99MS8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Tpgs1Q99MS8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Tpgs1Q99MS8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpgs1Q99MS8 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Tpgs1Q99MS8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpgs1Q99MS8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Tpgs1Q99MS8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpgs1Q99MS8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpgs1Q99MS8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpgs1Q99MS8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpgs1Q99MS8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Tpgs1Q99MS8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpgs1Q99MS8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Tpgs1Q99MS8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Tpgs1Q99MS8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpgs1Q99MS8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Tpgs1Q99MS8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpgs1Q99MS8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpgs1Q99MS8 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Tpgs1Q99MS8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Tpgs1Q99MS8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Tpgs1Q99MS8 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpgs1Q99MS8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Tpgs1Q99MS8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpgs1Q99MS8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpgs1Q99MS8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpgs1Q99MS8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Tpgs1Q99MS8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpgs1Q99MS8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpgs1Q99MS8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Tpgs1Q99MS8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Tpgs1Q99MS8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpgs1Q99MS8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Tpgs1Q99MS8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Tpgs1Q99MS8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpgs1Q99MS8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Tpgs1Q99MS8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpgs1Q99MS8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Tpgs1Q99MS8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Tpgs1Q99MS8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpgs1Q99MS8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Tpgs1Q99MS8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms