Protein–RNA interactions for Protein: Q99MH5

Nme5, Nucleoside diphosphate kinase homolog 5, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme5Q99MH5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Nme5Q99MH5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Nme5Q99MH5 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Nme5Q99MH5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Nme5Q99MH5 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Nme5Q99MH5 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme5Q99MH5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme5Q99MH5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Nme5Q99MH5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Nme5Q99MH5 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Nme5Q99MH5 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nme5Q99MH5 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nme5Q99MH5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Nme5Q99MH5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nme5Q99MH5 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Nme5Q99MH5 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Nme5Q99MH5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nme5Q99MH5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Nme5Q99MH5 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nme5Q99MH5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nme5Q99MH5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Nme5Q99MH5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Nme5Q99MH5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Nme5Q99MH5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Nme5Q99MH5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Nme5Q99MH5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nme5Q99MH5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Nme5Q99MH5 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nme5Q99MH5 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nme5Q99MH5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Nme5Q99MH5 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nme5Q99MH5 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nme5Q99MH5 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Nme5Q99MH5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Nme5Q99MH5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Nme5Q99MH5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Nme5Q99MH5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Nme5Q99MH5 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Nme5Q99MH5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nme5Q99MH5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nme5Q99MH5 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nme5Q99MH5 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nme5Q99MH5 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Nme5Q99MH5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nme5Q99MH5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nme5Q99MH5 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Nme5Q99MH5 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Nme5Q99MH5 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Nme5Q99MH5 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 235.9 ms