Protein–RNA interactions for Protein: Q99LY2

Gdpd3, Lysophospholipase D GDPD3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpd3Q99LY2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gdpd3Q99LY2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdpd3Q99LY2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdpd3Q99LY2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gdpd3Q99LY2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gdpd3Q99LY2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd3Q99LY2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd3Q99LY2 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd3Q99LY2 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd3Q99LY2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gdpd3Q99LY2 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Gdpd3Q99LY2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Gdpd3Q99LY2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd3Q99LY2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Gdpd3Q99LY2 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Gdpd3Q99LY2 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Gdpd3Q99LY2 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Gdpd3Q99LY2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpd3Q99LY2 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Gdpd3Q99LY2 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Gdpd3Q99LY2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpd3Q99LY2 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Gdpd3Q99LY2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpd3Q99LY2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Gdpd3Q99LY2 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd3Q99LY2 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Gdpd3Q99LY2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpd3Q99LY2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Gdpd3Q99LY2 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd3Q99LY2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd3Q99LY2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd3Q99LY2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Gdpd3Q99LY2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdpd3Q99LY2 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Gdpd3Q99LY2 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd3Q99LY2 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd3Q99LY2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Gdpd3Q99LY2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Gdpd3Q99LY2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Gdpd3Q99LY2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Gdpd3Q99LY2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Gdpd3Q99LY2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Gdpd3Q99LY2 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Gdpd3Q99LY2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd3Q99LY2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd3Q99LY2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd3Q99LY2 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Gdpd3Q99LY2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd3Q99LY2 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Gdpd3Q99LY2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Gdpd3Q99LY2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpd3Q99LY2 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Gdpd3Q99LY2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Gdpd3Q99LY2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Gdpd3Q99LY2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.3 ms