Protein–RNA interactions for Protein: Q99L02

Pagr1a, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1A, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pagr1aQ99L02 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Pagr1aQ99L02 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pagr1aQ99L02 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Pagr1aQ99L02 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Pagr1aQ99L02 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Pagr1aQ99L02 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30■■■□□ 2.39
Pagr1aQ99L02 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pagr1aQ99L02 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pagr1aQ99L02 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pagr1aQ99L02 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
Pagr1aQ99L02 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29.98■■■□□ 2.39
Pagr1aQ99L02 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
Pagr1aQ99L02 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pagr1aQ99L02 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pagr1aQ99L02 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC29.96■■■□□ 2.39
Pagr1aQ99L02 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
Pagr1aQ99L02 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pagr1aQ99L02 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
Pagr1aQ99L02 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
Pagr1aQ99L02 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
Pagr1aQ99L02 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
Pagr1aQ99L02 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC29.88■■■□□ 2.37
Pagr1aQ99L02 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Pagr1aQ99L02 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
Pagr1aQ99L02 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Pagr1aQ99L02 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.37
Pagr1aQ99L02 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
Pagr1aQ99L02 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
Pagr1aQ99L02 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pagr1aQ99L02 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
Pagr1aQ99L02 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
Pagr1aQ99L02 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
Pagr1aQ99L02 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Pagr1aQ99L02 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29.74■■■□□ 2.35
Pagr1aQ99L02 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
Pagr1aQ99L02 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
Pagr1aQ99L02 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pagr1aQ99L02 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pagr1aQ99L02 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Pagr1aQ99L02 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pagr1aQ99L02 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
Pagr1aQ99L02 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
Pagr1aQ99L02 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pagr1aQ99L02 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Pagr1aQ99L02 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pagr1aQ99L02 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pagr1aQ99L02 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Pagr1aQ99L02 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pagr1aQ99L02 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
Pagr1aQ99L02 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
Pagr1aQ99L02 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
Pagr1aQ99L02 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pagr1aQ99L02 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pagr1aQ99L02 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pagr1aQ99L02 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
Pagr1aQ99L02 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
Pagr1aQ99L02 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pagr1aQ99L02 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pagr1aQ99L02 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Pagr1aQ99L02 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
Pagr1aQ99L02 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
Pagr1aQ99L02 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
Pagr1aQ99L02 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
Pagr1aQ99L02 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pagr1aQ99L02 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pagr1aQ99L02 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pagr1aQ99L02 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pagr1aQ99L02 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pagr1aQ99L02 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Pagr1aQ99L02 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC29.46■■■□□ 2.31
Pagr1aQ99L02 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Pagr1aQ99L02 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Pagr1aQ99L02 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Pagr1aQ99L02 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pagr1aQ99L02 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
Pagr1aQ99L02 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pagr1aQ99L02 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Pagr1aQ99L02 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pagr1aQ99L02 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Pagr1aQ99L02 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
Pagr1aQ99L02 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pagr1aQ99L02 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pagr1aQ99L02 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pagr1aQ99L02 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pagr1aQ99L02 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Pagr1aQ99L02 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Pagr1aQ99L02 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms