Protein–RNA interactions for Protein: Q99K10

Nlgn1, Neuroligin-1, mousemouse

Predictions only

Length 843 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlgn1Q99K10 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Nlgn1Q99K10 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Nlgn1Q99K10 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Nlgn1Q99K10 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Nlgn1Q99K10 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
Nlgn1Q99K10 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Nlgn1Q99K10 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Nlgn1Q99K10 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Nlgn1Q99K10 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.61■■■■□ 3.13
Nlgn1Q99K10 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Nlgn1Q99K10 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Nlgn1Q99K10 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.6■■■■□ 3.13
Nlgn1Q99K10 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Nlgn1Q99K10 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Nlgn1Q99K10 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Nlgn1Q99K10 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Nlgn1Q99K10 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Nlgn1Q99K10 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Nlgn1Q99K10 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Nlgn1Q99K10 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Nlgn1Q99K10 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC34.46■■■■□ 3.11
Nlgn1Q99K10 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Nlgn1Q99K10 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Nlgn1Q99K10 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Nlgn1Q99K10 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nlgn1Q99K10 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC34.41■■■■□ 3.1
Nlgn1Q99K10 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Nlgn1Q99K10 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Nlgn1Q99K10 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Nlgn1Q99K10 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Nlgn1Q99K10 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Nlgn1Q99K10 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Nlgn1Q99K10 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.29■■■■□ 3.08
Nlgn1Q99K10 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.28■■■■□ 3.08
Nlgn1Q99K10 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Nlgn1Q99K10 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nlgn1Q99K10 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nlgn1Q99K10 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Nlgn1Q99K10 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Nlgn1Q99K10 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Nlgn1Q99K10 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.22■■■■□ 3.07
Nlgn1Q99K10 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Nlgn1Q99K10 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Nlgn1Q99K10 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Nlgn1Q99K10 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nlgn1Q99K10 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.19■■■■□ 3.06
Nlgn1Q99K10 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Nlgn1Q99K10 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.17■■■■□ 3.06
Nlgn1Q99K10 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nlgn1Q99K10 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Nlgn1Q99K10 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Nlgn1Q99K10 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.16■■■■□ 3.06
Nlgn1Q99K10 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nlgn1Q99K10 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nlgn1Q99K10 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nlgn1Q99K10 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Nlgn1Q99K10 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nlgn1Q99K10 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Nlgn1Q99K10 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nlgn1Q99K10 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Nlgn1Q99K10 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nlgn1Q99K10 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Nlgn1Q99K10 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Nlgn1Q99K10 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Nlgn1Q99K10 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Nlgn1Q99K10 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Nlgn1Q99K10 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Nlgn1Q99K10 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Nlgn1Q99K10 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.06■■■■□ 3.04
Nlgn1Q99K10 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.05■■■■□ 3.04
Nlgn1Q99K10 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Nlgn1Q99K10 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Nlgn1Q99K10 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC34.04■■■■□ 3.04
Nlgn1Q99K10 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Nlgn1Q99K10 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nlgn1Q99K10 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Nlgn1Q99K10 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34■■■■□ 3.03
Nlgn1Q99K10 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nlgn1Q99K10 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Nlgn1Q99K10 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
Nlgn1Q99K10 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Nlgn1Q99K10 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
Nlgn1Q99K10 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nlgn1Q99K10 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nlgn1Q99K10 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nlgn1Q99K10 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Nlgn1Q99K10 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Nlgn1Q99K10 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nlgn1Q99K10 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nlgn1Q99K10 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Nlgn1Q99K10 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nlgn1Q99K10 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nlgn1Q99K10 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Nlgn1Q99K10 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Nlgn1Q99K10 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC33.86■■■■□ 3.01
Nlgn1Q99K10 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Nlgn1Q99K10 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC33.85■■■■□ 3.01
Nlgn1Q99K10 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Nlgn1Q99K10 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.82■■■■□ 3
Nlgn1Q99K10 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC33.79■■■■□ 3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.4 ms