Protein–RNA interactions for Protein: Q99JW4

Lims1, LIM and senescent cell antigen-like-containing domain protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lims1Q99JW4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Lims1Q99JW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lims1Q99JW4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lims1Q99JW4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lims1Q99JW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Lims1Q99JW4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lims1Q99JW4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Lims1Q99JW4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Lims1Q99JW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Lims1Q99JW4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lims1Q99JW4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Lims1Q99JW4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Lims1Q99JW4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Lims1Q99JW4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Lims1Q99JW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lims1Q99JW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Lims1Q99JW4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Lims1Q99JW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lims1Q99JW4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Lims1Q99JW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Lims1Q99JW4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Lims1Q99JW4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lims1Q99JW4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Lims1Q99JW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lims1Q99JW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Lims1Q99JW4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Lims1Q99JW4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lims1Q99JW4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Lims1Q99JW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lims1Q99JW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Lims1Q99JW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Lims1Q99JW4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Lims1Q99JW4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lims1Q99JW4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lims1Q99JW4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Lims1Q99JW4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Lims1Q99JW4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lims1Q99JW4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Lims1Q99JW4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Lims1Q99JW4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Lims1Q99JW4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms