Protein–RNA interactions for Protein: Q99J59

Tspan1, Tetraspanin-1, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tspan1Q99J59 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tspan1Q99J59 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tspan1Q99J59 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tspan1Q99J59 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tspan1Q99J59 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tspan1Q99J59 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tspan1Q99J59 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tspan1Q99J59 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tspan1Q99J59 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tspan1Q99J59 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tspan1Q99J59 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tspan1Q99J59 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tspan1Q99J59 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tspan1Q99J59 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tspan1Q99J59 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tspan1Q99J59 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tspan1Q99J59 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tspan1Q99J59 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tspan1Q99J59 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tspan1Q99J59 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Tspan1Q99J59 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tspan1Q99J59 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tspan1Q99J59 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tspan1Q99J59 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tspan1Q99J59 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tspan1Q99J59 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tspan1Q99J59 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tspan1Q99J59 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tspan1Q99J59 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tspan1Q99J59 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Tspan1Q99J59 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tspan1Q99J59 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tspan1Q99J59 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tspan1Q99J59 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tspan1Q99J59 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tspan1Q99J59 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tspan1Q99J59 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tspan1Q99J59 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Tspan1Q99J59 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tspan1Q99J59 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Tspan1Q99J59 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Tspan1Q99J59 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Tspan1Q99J59 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Tspan1Q99J59 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Tspan1Q99J59 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Tspan1Q99J59 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Tspan1Q99J59 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Tspan1Q99J59 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tspan1Q99J59 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Tspan1Q99J59 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tspan1Q99J59 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tspan1Q99J59 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
Tspan1Q99J59 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Tspan1Q99J59 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Tspan1Q99J59 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Tspan1Q99J59 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tspan1Q99J59 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Tspan1Q99J59 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Tspan1Q99J59 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Tspan1Q99J59 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Tspan1Q99J59 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Tspan1Q99J59 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan1Q99J59 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Tspan1Q99J59 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan1Q99J59 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan1Q99J59 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan1Q99J59 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Tspan1Q99J59 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tspan1Q99J59 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Tspan1Q99J59 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tspan1Q99J59 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Tspan1Q99J59 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Tspan1Q99J59 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms