Protein–RNA interactions for Protein: Q99J56

Derl1, Derlin-1, mousemouse

Predictions only

Length 251 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl1Q99J56 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Derl1Q99J56 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Derl1Q99J56 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Derl1Q99J56 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Derl1Q99J56 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Derl1Q99J56 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Derl1Q99J56 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Derl1Q99J56 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Derl1Q99J56 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Derl1Q99J56 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Derl1Q99J56 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Derl1Q99J56 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Derl1Q99J56 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Derl1Q99J56 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Derl1Q99J56 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Derl1Q99J56 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Derl1Q99J56 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Derl1Q99J56 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.8 ms