Protein–RNA interactions for Protein: Q925Q3

Slc8b1, Mitochondrial sodium/calcium exchanger protein, mousemouse

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Length 585 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc8b1Q925Q3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc8b1Q925Q3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc8b1Q925Q3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Slc8b1Q925Q3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc8b1Q925Q3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Slc8b1Q925Q3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc8b1Q925Q3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc8b1Q925Q3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Slc8b1Q925Q3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Slc8b1Q925Q3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Slc8b1Q925Q3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Slc8b1Q925Q3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc8b1Q925Q3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc8b1Q925Q3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Slc8b1Q925Q3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Slc8b1Q925Q3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Slc8b1Q925Q3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc8b1Q925Q3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc8b1Q925Q3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Slc8b1Q925Q3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8b1Q925Q3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Slc8b1Q925Q3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Slc8b1Q925Q3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Slc8b1Q925Q3 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc8b1Q925Q3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Slc8b1Q925Q3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc8b1Q925Q3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc8b1Q925Q3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Slc8b1Q925Q3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8b1Q925Q3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Slc8b1Q925Q3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc8b1Q925Q3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Slc8b1Q925Q3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Slc8b1Q925Q3 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Slc8b1Q925Q3 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Slc8b1Q925Q3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Slc8b1Q925Q3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc8b1Q925Q3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Slc8b1Q925Q3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc8b1Q925Q3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Slc8b1Q925Q3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Slc8b1Q925Q3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Slc8b1Q925Q3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Slc8b1Q925Q3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Slc8b1Q925Q3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc8b1Q925Q3 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc8b1Q925Q3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Slc8b1Q925Q3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc8b1Q925Q3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc8b1Q925Q3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc8b1Q925Q3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Slc8b1Q925Q3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Slc8b1Q925Q3 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Slc8b1Q925Q3 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Slc8b1Q925Q3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms