Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SptssbQ925E8 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
SptssbQ925E8 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
SptssbQ925E8 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
SptssbQ925E8 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
SptssbQ925E8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
SptssbQ925E8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.47□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.3 ms