Protein–RNA interactions for Protein: Q924S9

Ripply3, Protein ripply3, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripply3Q924S9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ripply3Q924S9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ripply3Q924S9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ripply3Q924S9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ripply3Q924S9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ripply3Q924S9 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ripply3Q924S9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ripply3Q924S9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ripply3Q924S9 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ripply3Q924S9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ripply3Q924S9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ripply3Q924S9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ripply3Q924S9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Ripply3Q924S9 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ripply3Q924S9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ripply3Q924S9 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ripply3Q924S9 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ripply3Q924S9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ripply3Q924S9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ripply3Q924S9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ripply3Q924S9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ripply3Q924S9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ripply3Q924S9 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ripply3Q924S9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ripply3Q924S9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ripply3Q924S9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ripply3Q924S9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ripply3Q924S9 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ripply3Q924S9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ripply3Q924S9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ripply3Q924S9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ripply3Q924S9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ripply3Q924S9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ripply3Q924S9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ripply3Q924S9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ripply3Q924S9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ripply3Q924S9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ripply3Q924S9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ripply3Q924S9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ripply3Q924S9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ripply3Q924S9 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripply3Q924S9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripply3Q924S9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ripply3Q924S9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ripply3Q924S9 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ripply3Q924S9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ripply3Q924S9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Ripply3Q924S9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Ripply3Q924S9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms