Protein–RNA interactions for Protein: Q921I6

Sh3bp4, SH3 domain-binding protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 962 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3bp4Q921I6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp4Q921I6 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Sh3bp4Q921I6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Sh3bp4Q921I6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Sh3bp4Q921I6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Sh3bp4Q921I6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Sh3bp4Q921I6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Sh3bp4Q921I6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bp4Q921I6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
Sh3bp4Q921I6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Sh3bp4Q921I6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Sh3bp4Q921I6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Sh3bp4Q921I6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp4Q921I6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp4Q921I6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Sh3bp4Q921I6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp4Q921I6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp4Q921I6 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Sh3bp4Q921I6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Sh3bp4Q921I6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Sh3bp4Q921I6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Sh3bp4Q921I6 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp4Q921I6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Sh3bp4Q921I6 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Sh3bp4Q921I6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp4Q921I6 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Sh3bp4Q921I6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Sh3bp4Q921I6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Sh3bp4Q921I6 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Sh3bp4Q921I6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Sh3bp4Q921I6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms