Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SncbQ91ZZ3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SncbQ91ZZ3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SncbQ91ZZ3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SncbQ91ZZ3 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SncbQ91ZZ3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SncbQ91ZZ3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SncbQ91ZZ3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SncbQ91ZZ3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SncbQ91ZZ3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SncbQ91ZZ3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SncbQ91ZZ3 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SncbQ91ZZ3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SncbQ91ZZ3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SncbQ91ZZ3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SncbQ91ZZ3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SncbQ91ZZ3 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SncbQ91ZZ3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SncbQ91ZZ3 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SncbQ91ZZ3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SncbQ91ZZ3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
SncbQ91ZZ3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SncbQ91ZZ3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SncbQ91ZZ3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SncbQ91ZZ3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
SncbQ91ZZ3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
SncbQ91ZZ3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
SncbQ91ZZ3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SncbQ91ZZ3 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
SncbQ91ZZ3 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
SncbQ91ZZ3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
SncbQ91ZZ3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SncbQ91ZZ3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
SncbQ91ZZ3 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
SncbQ91ZZ3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
SncbQ91ZZ3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
SncbQ91ZZ3 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SncbQ91ZZ3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SncbQ91ZZ3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms