Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pde6cQ91ZQ1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pde6cQ91ZQ1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pde6cQ91ZQ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Pde6cQ91ZQ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
Pde6cQ91ZQ1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pde6cQ91ZQ1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Pde6cQ91ZQ1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pde6cQ91ZQ1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Pde6cQ91ZQ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pde6cQ91ZQ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pde6cQ91ZQ1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Pde6cQ91ZQ1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde6cQ91ZQ1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Pde6cQ91ZQ1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Pde6cQ91ZQ1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Pde6cQ91ZQ1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde6cQ91ZQ1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Pde6cQ91ZQ1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pde6cQ91ZQ1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pde6cQ91ZQ1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pde6cQ91ZQ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Pde6cQ91ZQ1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pde6cQ91ZQ1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Pde6cQ91ZQ1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Pde6cQ91ZQ1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Pde6cQ91ZQ1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pde6cQ91ZQ1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Pde6cQ91ZQ1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Pde6cQ91ZQ1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Pde6cQ91ZQ1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Pde6cQ91ZQ1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Pde6cQ91ZQ1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Pde6cQ91ZQ1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Pde6cQ91ZQ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pde6cQ91ZQ1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Pde6cQ91ZQ1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Pde6cQ91ZQ1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pde6cQ91ZQ1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Pde6cQ91ZQ1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Pde6cQ91ZQ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Pde6cQ91ZQ1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde6cQ91ZQ1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde6cQ91ZQ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Pde6cQ91ZQ1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Pde6cQ91ZQ1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pde6cQ91ZQ1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Pde6cQ91ZQ1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde6cQ91ZQ1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde6cQ91ZQ1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Pde6cQ91ZQ1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Pde6cQ91ZQ1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Pde6cQ91ZQ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Pde6cQ91ZQ1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Pde6cQ91ZQ1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Pde6cQ91ZQ1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde6cQ91ZQ1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde6cQ91ZQ1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Pde6cQ91ZQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Pde6cQ91ZQ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1826.4 ms