Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Ttc1Q91Z38 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Ttc1Q91Z38 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc1Q91Z38 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc1Q91Z38 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc1Q91Z38 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Ttc1Q91Z38 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc1Q91Z38 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Ttc1Q91Z38 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Ttc1Q91Z38 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc1Q91Z38 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Ttc1Q91Z38 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Ttc1Q91Z38 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc1Q91Z38 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc1Q91Z38 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Ttc1Q91Z38 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Ttc1Q91Z38 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc1Q91Z38 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc1Q91Z38 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Ttc1Q91Z38 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Ttc1Q91Z38 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc1Q91Z38 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Ttc1Q91Z38 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc1Q91Z38 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc1Q91Z38 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Ttc1Q91Z38 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ttc1Q91Z38 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ttc1Q91Z38 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ttc1Q91Z38 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc1Q91Z38 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ttc1Q91Z38 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc1Q91Z38 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ttc1Q91Z38 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc1Q91Z38 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ttc1Q91Z38 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc1Q91Z38 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc1Q91Z38 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ttc1Q91Z38 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Ttc1Q91Z38 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc1Q91Z38 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
Ttc1Q91Z38 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Ttc1Q91Z38 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc1Q91Z38 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Ttc1Q91Z38 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Ttc1Q91Z38 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Ttc1Q91Z38 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Ttc1Q91Z38 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc1Q91Z38 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Ttc1Q91Z38 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc1Q91Z38 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc1Q91Z38 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Ttc1Q91Z38 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc1Q91Z38 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Ttc1Q91Z38 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc1Q91Z38 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ttc1Q91Z38 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc1Q91Z38 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ttc1Q91Z38 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc1Q91Z38 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc1Q91Z38 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc1Q91Z38 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ttc1Q91Z38 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ttc1Q91Z38 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc1Q91Z38 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ttc1Q91Z38 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc1Q91Z38 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ttc1Q91Z38 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
Ttc1Q91Z38 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Ttc1Q91Z38 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Ttc1Q91Z38 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc1Q91Z38 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ttc1Q91Z38 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc1Q91Z38 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Ttc1Q91Z38 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ttc1Q91Z38 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms