Protein–RNA interactions for Protein: Q91YD4

Trpm2, Transient receptor potential cation channel subfamily M member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpm2Q91YD4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,34■■■■□ 3,73
Trpm2Q91YD4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,34■■■■□ 3,73
Trpm2Q91YD4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC38,33■■■■□ 3,73
Trpm2Q91YD4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC38,33■■■■□ 3,73
Trpm2Q91YD4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC38,32■■■■□ 3,72
Trpm2Q91YD4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,32■■■■□ 3,72
Trpm2Q91YD4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
Trpm2Q91YD4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC38,29■■■■□ 3,72
Trpm2Q91YD4 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,26■■■■□ 3,72
Trpm2Q91YD4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,26■■■■□ 3,71
Trpm2Q91YD4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,24■■■■□ 3,71
Trpm2Q91YD4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC38,23■■■■□ 3,71
Trpm2Q91YD4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Trpm2Q91YD4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC38,22■■■■□ 3,71
Trpm2Q91YD4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Trpm2Q91YD4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Trpm2Q91YD4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC38,2■■■■□ 3,71
Trpm2Q91YD4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC38,18■■■■□ 3,7
Trpm2Q91YD4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC38,18■■■■□ 3,7
Trpm2Q91YD4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,14■■■■□ 3,7
Trpm2Q91YD4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC38,14■■■■□ 3,7
Trpm2Q91YD4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,09■■■■□ 3,69
Trpm2Q91YD4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,08■■■■□ 3,69
Trpm2Q91YD4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC38,07■■■■□ 3,69
Trpm2Q91YD4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC38,07■■■■□ 3,68
Trpm2Q91YD4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC38,05■■■■□ 3,68
Trpm2Q91YD4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC38,04■■■■□ 3,68
Trpm2Q91YD4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC38,02■■■■□ 3,68
Trpm2Q91YD4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC38■■■■□ 3,67
Trpm2Q91YD4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,99■■■■□ 3,67
Trpm2Q91YD4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,98■■■■□ 3,67
Trpm2Q91YD4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,67
Trpm2Q91YD4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,95■■■■□ 3,66
Trpm2Q91YD4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Trpm2Q91YD4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,94■■■■□ 3,66
Trpm2Q91YD4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,93■■■■□ 3,66
Trpm2Q91YD4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,92■■■■□ 3,66
Trpm2Q91YD4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,9■■■■□ 3,66
Trpm2Q91YD4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC37,89■■■■□ 3,66
Trpm2Q91YD4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,88■■■■□ 3,65
Trpm2Q91YD4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37,88■■■■□ 3,65
Trpm2Q91YD4 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC37,87■■■■□ 3,65
Trpm2Q91YD4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Trpm2Q91YD4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC37,86■■■■□ 3,65
Trpm2Q91YD4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,83■■■■□ 3,65
Trpm2Q91YD4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC37,82■■■■□ 3,65
Trpm2Q91YD4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC37,82■■■■□ 3,65
Trpm2Q91YD4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC37,79■■■■□ 3,64
Trpm2Q91YD4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Trpm2Q91YD4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC37,78■■■■□ 3,64
Trpm2Q91YD4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC37,78■■■■□ 3,64
Trpm2Q91YD4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Trpm2Q91YD4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,77■■■■□ 3,64
Trpm2Q91YD4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,76■■■■□ 3,63
Trpm2Q91YD4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC37,75■■■■□ 3,63
Trpm2Q91YD4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC37,73■■■■□ 3,63
Trpm2Q91YD4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,73■■■■□ 3,63
Trpm2Q91YD4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,73■■■■□ 3,63
Trpm2Q91YD4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC37,72■■■■□ 3,63
Trpm2Q91YD4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC37,64■■■■□ 3,62
Trpm2Q91YD4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Trpm2Q91YD4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC37,64■■■■□ 3,62
Trpm2Q91YD4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,64■■■■□ 3,62
Trpm2Q91YD4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,62■■■■□ 3,61
Trpm2Q91YD4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37,61■■■■□ 3,61
Trpm2Q91YD4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC37,61■■■■□ 3,61
Trpm2Q91YD4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC37,6■■■■□ 3,61
Trpm2Q91YD4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,6■■■■□ 3,61
Trpm2Q91YD4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37,59■■■■□ 3,61
Trpm2Q91YD4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Trpm2Q91YD4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37,58■■■■□ 3,61
Trpm2Q91YD4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,58■■■■□ 3,61
Trpm2Q91YD4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC37,58■■■■□ 3,61
Trpm2Q91YD4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC37,56■■■■□ 3,6
Trpm2Q91YD4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,55■■■■□ 3,6
Trpm2Q91YD4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC37,53■■■■□ 3,6
Trpm2Q91YD4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Trpm2Q91YD4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37,53■■■■□ 3,6
Trpm2Q91YD4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC37,51■■■■□ 3,6
Trpm2Q91YD4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,51■■■■□ 3,59
Trpm2Q91YD4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC37,5■■■■□ 3,59
Trpm2Q91YD4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Trpm2Q91YD4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,49■■■■□ 3,59
Trpm2Q91YD4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC37,48■■■■□ 3,59
Trpm2Q91YD4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,47■■■■□ 3,59
Trpm2Q91YD4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC37,46■■■■□ 3,59
Trpm2Q91YD4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,45■■■■□ 3,59
Trpm2Q91YD4 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,44■■■■□ 3,58
Trpm2Q91YD4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC37,41■■■■□ 3,58
Trpm2Q91YD4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Trpm2Q91YD4 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC37,4■■■■□ 3,58
Trpm2Q91YD4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Trpm2Q91YD4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC37,39■■■■□ 3,58
Trpm2Q91YD4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,38■■■■□ 3,57
Trpm2Q91YD4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC37,37■■■■□ 3,57
Trpm2Q91YD4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Trpm2Q91YD4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC37,36■■■■□ 3,57
Trpm2Q91YD4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,36■■■■□ 3,57
Trpm2Q91YD4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC37,34■■■■□ 3,57
Trpm2Q91YD4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37,32■■■■□ 3,57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,9 ms