Protein–RNA interactions for Protein: Q91WG3

Trub2, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Trub2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trub2Q91WG3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trub2Q91WG3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Trub2Q91WG3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trub2Q91WG3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trub2Q91WG3 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Trub2Q91WG3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Trub2Q91WG3 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trub2Q91WG3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Trub2Q91WG3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Trub2Q91WG3 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trub2Q91WG3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trub2Q91WG3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Trub2Q91WG3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trub2Q91WG3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trub2Q91WG3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trub2Q91WG3 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Trub2Q91WG3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Trub2Q91WG3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trub2Q91WG3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Trub2Q91WG3 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.51■■■□□ 2.16
Trub2Q91WG3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Trub2Q91WG3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trub2Q91WG3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Trub2Q91WG3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Trub2Q91WG3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Trub2Q91WG3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Trub2Q91WG3 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Trub2Q91WG3 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trub2Q91WG3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Trub2Q91WG3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trub2Q91WG3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trub2Q91WG3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Trub2Q91WG3 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Trub2Q91WG3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Trub2Q91WG3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trub2Q91WG3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Trub2Q91WG3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trub2Q91WG3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Trub2Q91WG3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trub2Q91WG3 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trub2Q91WG3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Trub2Q91WG3 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Trub2Q91WG3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Trub2Q91WG3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Trub2Q91WG3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Trub2Q91WG3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Trub2Q91WG3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC28.26■■■□□ 2.12
Trub2Q91WG3 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trub2Q91WG3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Trub2Q91WG3 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Trub2Q91WG3 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trub2Q91WG3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trub2Q91WG3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Trub2Q91WG3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trub2Q91WG3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trub2Q91WG3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Trub2Q91WG3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Trub2Q91WG3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Trub2Q91WG3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Trub2Q91WG3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trub2Q91WG3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trub2Q91WG3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trub2Q91WG3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trub2Q91WG3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trub2Q91WG3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Trub2Q91WG3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trub2Q91WG3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
Trub2Q91WG3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Trub2Q91WG3 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
Trub2Q91WG3 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Trub2Q91WG3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Trub2Q91WG3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Trub2Q91WG3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Trub2Q91WG3 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Trub2Q91WG3 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Trub2Q91WG3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trub2Q91WG3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
Trub2Q91WG3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
Trub2Q91WG3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Trub2Q91WG3 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trub2Q91WG3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Trub2Q91WG3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trub2Q91WG3 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Trub2Q91WG3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trub2Q91WG3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Trub2Q91WG3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trub2Q91WG3 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trub2Q91WG3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Trub2Q91WG3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Trub2Q91WG3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
Trub2Q91WG3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trub2Q91WG3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trub2Q91WG3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Trub2Q91WG3 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Trub2Q91WG3 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trub2Q91WG3 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Trub2Q91WG3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Trub2Q91WG3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Trub2Q91WG3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
Trub2Q91WG3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms