Protein–RNA interactions for Protein: Q91W27

Pth2, Tuberoinfundibular peptide of 39 residues, mousemouse

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pth2Q91W27 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pth2Q91W27 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pth2Q91W27 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Pth2Q91W27 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pth2Q91W27 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pth2Q91W27 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Pth2Q91W27 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Pth2Q91W27 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Pth2Q91W27 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Pth2Q91W27 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Pth2Q91W27 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pth2Q91W27 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pth2Q91W27 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Pth2Q91W27 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pth2Q91W27 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Pth2Q91W27 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pth2Q91W27 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pth2Q91W27 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Pth2Q91W27 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pth2Q91W27 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Pth2Q91W27 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Pth2Q91W27 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Pth2Q91W27 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Pth2Q91W27 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Pth2Q91W27 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pth2Q91W27 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Pth2Q91W27 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pth2Q91W27 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Pth2Q91W27 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pth2Q91W27 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pth2Q91W27 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pth2Q91W27 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pth2Q91W27 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Pth2Q91W27 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Pth2Q91W27 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Pth2Q91W27 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Pth2Q91W27 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pth2Q91W27 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pth2Q91W27 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Pth2Q91W27 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Pth2Q91W27 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Pth2Q91W27 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pth2Q91W27 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Pth2Q91W27 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Pth2Q91W27 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pth2Q91W27 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Pth2Q91W27 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.9 ms