Protein–RNA interactions for Protein: Q91VE6

Nifk, MKI67 FHA domain-interacting nucleolar phosphoprotein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NifkQ91VE6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NifkQ91VE6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NifkQ91VE6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NifkQ91VE6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NifkQ91VE6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NifkQ91VE6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NifkQ91VE6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NifkQ91VE6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
NifkQ91VE6 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
NifkQ91VE6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NifkQ91VE6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
NifkQ91VE6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
NifkQ91VE6 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
NifkQ91VE6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
NifkQ91VE6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
NifkQ91VE6 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
NifkQ91VE6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
NifkQ91VE6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
NifkQ91VE6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
NifkQ91VE6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
NifkQ91VE6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
NifkQ91VE6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
NifkQ91VE6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
NifkQ91VE6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
NifkQ91VE6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
NifkQ91VE6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
NifkQ91VE6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NifkQ91VE6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
NifkQ91VE6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NifkQ91VE6 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
NifkQ91VE6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NifkQ91VE6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
NifkQ91VE6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
NifkQ91VE6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NifkQ91VE6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
NifkQ91VE6 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
NifkQ91VE6 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
NifkQ91VE6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
NifkQ91VE6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
NifkQ91VE6 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
NifkQ91VE6 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
NifkQ91VE6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
NifkQ91VE6 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
NifkQ91VE6 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
NifkQ91VE6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
NifkQ91VE6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
NifkQ91VE6 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
NifkQ91VE6 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NifkQ91VE6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
NifkQ91VE6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NifkQ91VE6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
NifkQ91VE6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NifkQ91VE6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
NifkQ91VE6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NifkQ91VE6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NifkQ91VE6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
NifkQ91VE6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
NifkQ91VE6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
NifkQ91VE6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
NifkQ91VE6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms