Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps4aQ8VEJ9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vps4aQ8VEJ9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps4aQ8VEJ9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vps4aQ8VEJ9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps4aQ8VEJ9 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps4aQ8VEJ9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vps4aQ8VEJ9 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vps4aQ8VEJ9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps4aQ8VEJ9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vps4aQ8VEJ9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps4aQ8VEJ9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps4aQ8VEJ9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps4aQ8VEJ9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps4aQ8VEJ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps4aQ8VEJ9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps4aQ8VEJ9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps4aQ8VEJ9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps4aQ8VEJ9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps4aQ8VEJ9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps4aQ8VEJ9 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps4aQ8VEJ9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps4aQ8VEJ9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps4aQ8VEJ9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps4aQ8VEJ9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps4aQ8VEJ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps4aQ8VEJ9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps4aQ8VEJ9 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps4aQ8VEJ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps4aQ8VEJ9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps4aQ8VEJ9 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps4aQ8VEJ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps4aQ8VEJ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps4aQ8VEJ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps4aQ8VEJ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps4aQ8VEJ9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps4aQ8VEJ9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps4aQ8VEJ9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps4aQ8VEJ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps4aQ8VEJ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps4aQ8VEJ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps4aQ8VEJ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps4aQ8VEJ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps4aQ8VEJ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps4aQ8VEJ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps4aQ8VEJ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps4aQ8VEJ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps4aQ8VEJ9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Vps4aQ8VEJ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Vps4aQ8VEJ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms