Protein–RNA interactions for Protein: Q8R263

Vmn1r198, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r198Q8R263 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Vmn1r198Q8R263 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn1r198Q8R263 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Vmn1r198Q8R263 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r198Q8R263 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r198Q8R263 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Vmn1r198Q8R263 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r198Q8R263 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Vmn1r198Q8R263 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Vmn1r198Q8R263 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Vmn1r198Q8R263 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r198Q8R263 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Vmn1r198Q8R263 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Vmn1r198Q8R263 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Vmn1r198Q8R263 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Vmn1r198Q8R263 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r198Q8R263 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Vmn1r198Q8R263 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r198Q8R263 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r198Q8R263 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Vmn1r198Q8R263 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Vmn1r198Q8R263 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r198Q8R263 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Vmn1r198Q8R263 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Vmn1r198Q8R263 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vmn1r198Q8R263 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r198Q8R263 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r198Q8R263 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r198Q8R263 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vmn1r198Q8R263 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r198Q8R263 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r198Q8R263 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vmn1r198Q8R263 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vmn1r198Q8R263 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r198Q8R263 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vmn1r198Q8R263 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vmn1r198Q8R263 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vmn1r198Q8R263 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vmn1r198Q8R263 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r198Q8R263 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vmn1r198Q8R263 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r198Q8R263 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r198Q8R263 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vmn1r198Q8R263 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r198Q8R263 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vmn1r198Q8R263 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vmn1r198Q8R263 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms