Protein–RNA interactions for Protein: Q8K558

Treml1, Trem-like transcript 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Treml1Q8K558 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Treml1Q8K558 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Treml1Q8K558 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Treml1Q8K558 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Treml1Q8K558 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Treml1Q8K558 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Treml1Q8K558 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Treml1Q8K558 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Treml1Q8K558 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Treml1Q8K558 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Treml1Q8K558 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Treml1Q8K558 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Treml1Q8K558 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Treml1Q8K558 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Treml1Q8K558 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Treml1Q8K558 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Treml1Q8K558 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Treml1Q8K558 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Treml1Q8K558 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Treml1Q8K558 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Treml1Q8K558 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Treml1Q8K558 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Treml1Q8K558 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Treml1Q8K558 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Treml1Q8K558 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Treml1Q8K558 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Treml1Q8K558 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Treml1Q8K558 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Treml1Q8K558 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Treml1Q8K558 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Treml1Q8K558 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Treml1Q8K558 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Treml1Q8K558 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Treml1Q8K558 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Treml1Q8K558 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Treml1Q8K558 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Treml1Q8K558 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Treml1Q8K558 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Treml1Q8K558 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Treml1Q8K558 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Treml1Q8K558 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Treml1Q8K558 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Treml1Q8K558 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Treml1Q8K558 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Treml1Q8K558 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Treml1Q8K558 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Treml1Q8K558 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Treml1Q8K558 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Treml1Q8K558 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Treml1Q8K558 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Treml1Q8K558 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Treml1Q8K558 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Treml1Q8K558 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Treml1Q8K558 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Treml1Q8K558 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Treml1Q8K558 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Treml1Q8K558 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Treml1Q8K558 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Treml1Q8K558 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms