Protein–RNA interactions for Protein: Q8K389

Cdk5rap2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,822 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap2Q8K389 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cdk5rap2Q8K389 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.16■■■■□ 3.38
Cdk5rap2Q8K389 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.15■■■■□ 3.38
Cdk5rap2Q8K389 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC36.13■■■■□ 3.37
Cdk5rap2Q8K389 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
Cdk5rap2Q8K389 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
Cdk5rap2Q8K389 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC36.11■■■■□ 3.37
Cdk5rap2Q8K389 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cdk5rap2Q8K389 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
Cdk5rap2Q8K389 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.36
Cdk5rap2Q8K389 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cdk5rap2Q8K389 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.06■■■■□ 3.36
Cdk5rap2Q8K389 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cdk5rap2Q8K389 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC36.05■■■■□ 3.36
Cdk5rap2Q8K389 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC36.04■■■■□ 3.36
Cdk5rap2Q8K389 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.03■■■■□ 3.36
Cdk5rap2Q8K389 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.02■■■■□ 3.36
Cdk5rap2Q8K389 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.01■■■■□ 3.36
Cdk5rap2Q8K389 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC36.01■■■■□ 3.35
Cdk5rap2Q8K389 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36■■■■□ 3.35
Cdk5rap2Q8K389 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cdk5rap2Q8K389 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cdk5rap2Q8K389 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.98■■■■□ 3.35
Cdk5rap2Q8K389 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.97■■■■□ 3.35
Cdk5rap2Q8K389 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.96■■■■□ 3.35
Cdk5rap2Q8K389 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.94■■■■□ 3.34
Cdk5rap2Q8K389 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC35.93■■■■□ 3.34
Cdk5rap2Q8K389 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC35.92■■■■□ 3.34
Cdk5rap2Q8K389 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.92■■■■□ 3.34
Cdk5rap2Q8K389 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.91■■■■□ 3.34
Cdk5rap2Q8K389 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cdk5rap2Q8K389 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.9■■■■□ 3.34
Cdk5rap2Q8K389 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cdk5rap2Q8K389 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cdk5rap2Q8K389 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35.89■■■■□ 3.34
Cdk5rap2Q8K389 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cdk5rap2Q8K389 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35.88■■■■□ 3.33
Cdk5rap2Q8K389 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.87■■■■□ 3.33
Cdk5rap2Q8K389 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.86■■■■□ 3.33
Cdk5rap2Q8K389 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.85■■■■□ 3.33
Cdk5rap2Q8K389 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cdk5rap2Q8K389 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC35.84■■■■□ 3.33
Cdk5rap2Q8K389 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35.81■■■■□ 3.32
Cdk5rap2Q8K389 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cdk5rap2Q8K389 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.8■■■■□ 3.32
Cdk5rap2Q8K389 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35.79■■■■□ 3.32
Cdk5rap2Q8K389 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.78■■■■□ 3.32
Cdk5rap2Q8K389 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cdk5rap2Q8K389 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cdk5rap2Q8K389 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.32
Cdk5rap2Q8K389 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.76■■■■□ 3.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC35.76■■■■□ 3.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC35.74■■■■□ 3.31
Cdk5rap2Q8K389 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.73■■■■□ 3.31
Cdk5rap2Q8K389 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35.72■■■■□ 3.31
Cdk5rap2Q8K389 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cdk5rap2Q8K389 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cdk5rap2Q8K389 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cdk5rap2Q8K389 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cdk5rap2Q8K389 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.71■■■■□ 3.31
Cdk5rap2Q8K389 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cdk5rap2Q8K389 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.69■■■■□ 3.3
Cdk5rap2Q8K389 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC35.69■■■■□ 3.3
Cdk5rap2Q8K389 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cdk5rap2Q8K389 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35.67■■■■□ 3.3
Cdk5rap2Q8K389 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35.65■■■■□ 3.3
Cdk5rap2Q8K389 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.64■■■■□ 3.3
Cdk5rap2Q8K389 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.61■■■■□ 3.29
Cdk5rap2Q8K389 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cdk5rap2Q8K389 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.6■■■■□ 3.29
Cdk5rap2Q8K389 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.59■■■■□ 3.29
Cdk5rap2Q8K389 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.57■■■■□ 3.28
Cdk5rap2Q8K389 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC35.54■■■■□ 3.28
Cdk5rap2Q8K389 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC35.53■■■■□ 3.28
Cdk5rap2Q8K389 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
Cdk5rap2Q8K389 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC35.48■■■■□ 3.27
Cdk5rap2Q8K389 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
Cdk5rap2Q8K389 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
Cdk5rap2Q8K389 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.43■■■■□ 3.26
Cdk5rap2Q8K389 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC35.42■■■■□ 3.26
Cdk5rap2Q8K389 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
Cdk5rap2Q8K389 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cdk5rap2Q8K389 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.41■■■■□ 3.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC35.39■■■■□ 3.26
Cdk5rap2Q8K389 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cdk5rap2Q8K389 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35.39■■■■□ 3.26
Cdk5rap2Q8K389 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
Cdk5rap2Q8K389 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35.35■■■■□ 3.25
Cdk5rap2Q8K389 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cdk5rap2Q8K389 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cdk5rap2Q8K389 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
Cdk5rap2Q8K389 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cdk5rap2Q8K389 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC35.33■■■■□ 3.25
Cdk5rap2Q8K389 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35.33■■■■□ 3.25
Cdk5rap2Q8K389 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC35.32■■■■□ 3.24
Cdk5rap2Q8K389 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cdk5rap2Q8K389 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cdk5rap2Q8K389 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
Cdk5rap2Q8K389 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.31■■■■□ 3.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms