Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ncapd2Q8K2Z4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ncapd2Q8K2Z4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ncapd2Q8K2Z4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Ncapd2Q8K2Z4 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ncapd2Q8K2Z4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ncapd2Q8K2Z4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ncapd2Q8K2Z4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ncapd2Q8K2Z4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ncapd2Q8K2Z4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ncapd2Q8K2Z4 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ncapd2Q8K2Z4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC34.65■■■■□ 3.14
Ncapd2Q8K2Z4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ncapd2Q8K2Z4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Ncapd2Q8K2Z4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Ncapd2Q8K2Z4 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Ncapd2Q8K2Z4 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ncapd2Q8K2Z4 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ncapd2Q8K2Z4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Ncapd2Q8K2Z4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ncapd2Q8K2Z4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ncapd2Q8K2Z4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC34.58■■■■□ 3.13
Ncapd2Q8K2Z4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ncapd2Q8K2Z4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Ncapd2Q8K2Z4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ncapd2Q8K2Z4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
Ncapd2Q8K2Z4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Ncapd2Q8K2Z4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC34.53■■■■□ 3.12
Ncapd2Q8K2Z4 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ncapd2Q8K2Z4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ncapd2Q8K2Z4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Ncapd2Q8K2Z4 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.11
Ncapd2Q8K2Z4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncapd2Q8K2Z4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncapd2Q8K2Z4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Ncapd2Q8K2Z4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ncapd2Q8K2Z4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ncapd2Q8K2Z4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Ncapd2Q8K2Z4 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ncapd2Q8K2Z4 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Ncapd2Q8K2Z4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC34.39■■■■□ 3.1
Ncapd2Q8K2Z4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ncapd2Q8K2Z4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.36■■■■□ 3.09
Ncapd2Q8K2Z4 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Ncapd2Q8K2Z4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.34■■■■□ 3.09
Ncapd2Q8K2Z4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ncapd2Q8K2Z4 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Ncapd2Q8K2Z4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ncapd2Q8K2Z4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ncapd2Q8K2Z4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Ncapd2Q8K2Z4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC34.26■■■■□ 3.08
Ncapd2Q8K2Z4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ncapd2Q8K2Z4 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Ncapd2Q8K2Z4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ncapd2Q8K2Z4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ncapd2Q8K2Z4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ncapd2Q8K2Z4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ncapd2Q8K2Z4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ncapd2Q8K2Z4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.07
Ncapd2Q8K2Z4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC34.19■■■■□ 3.06
Ncapd2Q8K2Z4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.17■■■■□ 3.06
Ncapd2Q8K2Z4 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC34.16■■■■□ 3.06
Ncapd2Q8K2Z4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ncapd2Q8K2Z4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.14■■■■□ 3.06
Ncapd2Q8K2Z4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.13■■■■□ 3.05
Ncapd2Q8K2Z4 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ncapd2Q8K2Z4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC34.12■■■■□ 3.05
Ncapd2Q8K2Z4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ncapd2Q8K2Z4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ncapd2Q8K2Z4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ncapd2Q8K2Z4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ncapd2Q8K2Z4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC34.08■■■■□ 3.05
Ncapd2Q8K2Z4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ncapd2Q8K2Z4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.06■■■■□ 3.04
Ncapd2Q8K2Z4 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ncapd2Q8K2Z4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ncapd2Q8K2Z4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ncapd2Q8K2Z4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ncapd2Q8K2Z4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ncapd2Q8K2Z4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC34.02■■■■□ 3.04
Ncapd2Q8K2Z4 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ncapd2Q8K2Z4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34■■■■□ 3.03
Ncapd2Q8K2Z4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ncapd2Q8K2Z4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Ncapd2Q8K2Z4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ncapd2Q8K2Z4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ncapd2Q8K2Z4 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC33.97■■■■□ 3.03
Ncapd2Q8K2Z4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ncapd2Q8K2Z4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ncapd2Q8K2Z4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ncapd2Q8K2Z4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ncapd2Q8K2Z4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ncapd2Q8K2Z4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ncapd2Q8K2Z4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Ncapd2Q8K2Z4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms