Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Y0

Rnf219, RING finger protein 219, mousemouse

Predictions only

Length 722 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf219Q8K2Y0 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Rnf219Q8K2Y0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Rnf219Q8K2Y0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf219Q8K2Y0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf219Q8K2Y0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Rnf219Q8K2Y0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Rnf219Q8K2Y0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf219Q8K2Y0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf219Q8K2Y0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Rnf219Q8K2Y0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf219Q8K2Y0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf219Q8K2Y0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Rnf219Q8K2Y0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Rnf219Q8K2Y0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf219Q8K2Y0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf219Q8K2Y0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Rnf219Q8K2Y0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Rnf219Q8K2Y0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Rnf219Q8K2Y0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf219Q8K2Y0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Rnf219Q8K2Y0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf219Q8K2Y0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Rnf219Q8K2Y0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf219Q8K2Y0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf219Q8K2Y0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf219Q8K2Y0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf219Q8K2Y0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Rnf219Q8K2Y0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Rnf219Q8K2Y0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Rnf219Q8K2Y0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf219Q8K2Y0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Rnf219Q8K2Y0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Rnf219Q8K2Y0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf219Q8K2Y0 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Rnf219Q8K2Y0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Rnf219Q8K2Y0 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf219Q8K2Y0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf219Q8K2Y0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Rnf219Q8K2Y0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Rnf219Q8K2Y0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf219Q8K2Y0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Rnf219Q8K2Y0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf219Q8K2Y0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf219Q8K2Y0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Rnf219Q8K2Y0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
Rnf219Q8K2Y0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf219Q8K2Y0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Rnf219Q8K2Y0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Rnf219Q8K2Y0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Rnf219Q8K2Y0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Rnf219Q8K2Y0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
Rnf219Q8K2Y0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Rnf219Q8K2Y0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf219Q8K2Y0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Rnf219Q8K2Y0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf219Q8K2Y0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf219Q8K2Y0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf219Q8K2Y0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Rnf219Q8K2Y0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf219Q8K2Y0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf219Q8K2Y0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf219Q8K2Y0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Rnf219Q8K2Y0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Rnf219Q8K2Y0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms