Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
Brd3Q8K2F0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brd3Q8K2F0 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brd3Q8K2F0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Brd3Q8K2F0 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Brd3Q8K2F0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Brd3Q8K2F0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
Brd3Q8K2F0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
Brd3Q8K2F0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Brd3Q8K2F0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brd3Q8K2F0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Brd3Q8K2F0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brd3Q8K2F0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Brd3Q8K2F0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Brd3Q8K2F0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Brd3Q8K2F0 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
Brd3Q8K2F0 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
Brd3Q8K2F0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
Brd3Q8K2F0 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
Brd3Q8K2F0 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Brd3Q8K2F0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Brd3Q8K2F0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brd3Q8K2F0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brd3Q8K2F0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
Brd3Q8K2F0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brd3Q8K2F0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Brd3Q8K2F0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brd3Q8K2F0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Brd3Q8K2F0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Brd3Q8K2F0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brd3Q8K2F0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Brd3Q8K2F0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brd3Q8K2F0 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brd3Q8K2F0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brd3Q8K2F0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Brd3Q8K2F0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Brd3Q8K2F0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Brd3Q8K2F0 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Brd3Q8K2F0 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Brd3Q8K2F0 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Brd3Q8K2F0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brd3Q8K2F0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Brd3Q8K2F0 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
Brd3Q8K2F0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Brd3Q8K2F0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Brd3Q8K2F0 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Brd3Q8K2F0 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brd3Q8K2F0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brd3Q8K2F0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brd3Q8K2F0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Brd3Q8K2F0 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Brd3Q8K2F0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Brd3Q8K2F0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brd3Q8K2F0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brd3Q8K2F0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brd3Q8K2F0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Brd3Q8K2F0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Brd3Q8K2F0 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms