Protein–RNA interactions for Protein: Q8K296

Mtmr3, Myotubularin-related protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mtmr3Q8K296 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Mtmr3Q8K296 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Mtmr3Q8K296 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mtmr3Q8K296 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mtmr3Q8K296 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mtmr3Q8K296 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Mtmr3Q8K296 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mtmr3Q8K296 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mtmr3Q8K296 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Mtmr3Q8K296 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Mtmr3Q8K296 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
Mtmr3Q8K296 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
Mtmr3Q8K296 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Mtmr3Q8K296 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Mtmr3Q8K296 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Mtmr3Q8K296 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mtmr3Q8K296 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mtmr3Q8K296 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mtmr3Q8K296 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mtmr3Q8K296 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Mtmr3Q8K296 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Mtmr3Q8K296 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Mtmr3Q8K296 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Mtmr3Q8K296 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mtmr3Q8K296 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Mtmr3Q8K296 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Mtmr3Q8K296 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Mtmr3Q8K296 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mtmr3Q8K296 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mtmr3Q8K296 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Mtmr3Q8K296 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mtmr3Q8K296 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Mtmr3Q8K296 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC28.83■■■□□ 2.21
Mtmr3Q8K296 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Mtmr3Q8K296 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mtmr3Q8K296 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mtmr3Q8K296 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Mtmr3Q8K296 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Mtmr3Q8K296 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Mtmr3Q8K296 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
Mtmr3Q8K296 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Mtmr3Q8K296 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mtmr3Q8K296 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Mtmr3Q8K296 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Mtmr3Q8K296 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mtmr3Q8K296 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
Mtmr3Q8K296 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Mtmr3Q8K296 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.19
Mtmr3Q8K296 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
Mtmr3Q8K296 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Mtmr3Q8K296 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Mtmr3Q8K296 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mtmr3Q8K296 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mtmr3Q8K296 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Mtmr3Q8K296 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mtmr3Q8K296 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Mtmr3Q8K296 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Mtmr3Q8K296 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mtmr3Q8K296 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Mtmr3Q8K296 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Mtmr3Q8K296 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Mtmr3Q8K296 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Mtmr3Q8K296 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Mtmr3Q8K296 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mtmr3Q8K296 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mtmr3Q8K296 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Mtmr3Q8K296 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Mtmr3Q8K296 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Mtmr3Q8K296 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mtmr3Q8K296 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Mtmr3Q8K296 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Mtmr3Q8K296 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Mtmr3Q8K296 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms