Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1Y2

Prkd3, Serine/threonine-protein kinase D3, mousemouse

Predictions only

Length 889 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prkd3Q8K1Y2 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Prkd3Q8K1Y2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkd3Q8K1Y2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Prkd3Q8K1Y2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Prkd3Q8K1Y2 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Prkd3Q8K1Y2 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Prkd3Q8K1Y2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkd3Q8K1Y2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Prkd3Q8K1Y2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkd3Q8K1Y2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkd3Q8K1Y2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkd3Q8K1Y2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Prkd3Q8K1Y2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Prkd3Q8K1Y2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Prkd3Q8K1Y2 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkd3Q8K1Y2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkd3Q8K1Y2 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Prkd3Q8K1Y2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Prkd3Q8K1Y2 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkd3Q8K1Y2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Prkd3Q8K1Y2 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkd3Q8K1Y2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Prkd3Q8K1Y2 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkd3Q8K1Y2 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Prkd3Q8K1Y2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkd3Q8K1Y2 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkd3Q8K1Y2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkd3Q8K1Y2 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Prkd3Q8K1Y2 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Prkd3Q8K1Y2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Prkd3Q8K1Y2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Prkd3Q8K1Y2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Prkd3Q8K1Y2 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Prkd3Q8K1Y2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Prkd3Q8K1Y2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Prkd3Q8K1Y2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkd3Q8K1Y2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Prkd3Q8K1Y2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkd3Q8K1Y2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Prkd3Q8K1Y2 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Prkd3Q8K1Y2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Prkd3Q8K1Y2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Prkd3Q8K1Y2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkd3Q8K1Y2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkd3Q8K1Y2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkd3Q8K1Y2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Prkd3Q8K1Y2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Prkd3Q8K1Y2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Prkd3Q8K1Y2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkd3Q8K1Y2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Prkd3Q8K1Y2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkd3Q8K1Y2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkd3Q8K1Y2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Prkd3Q8K1Y2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkd3Q8K1Y2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Prkd3Q8K1Y2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkd3Q8K1Y2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkd3Q8K1Y2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Prkd3Q8K1Y2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Prkd3Q8K1Y2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Prkd3Q8K1Y2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.5 ms