Protein–RNA interactions for Protein: Q8K193

Cldn34c1, Claudin 34C1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c1Q8K193 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34c1Q8K193 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34c1Q8K193 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Cldn34c1Q8K193 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34c1Q8K193 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Cldn34c1Q8K193 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn34c1Q8K193 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Cldn34c1Q8K193 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34c1Q8K193 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34c1Q8K193 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Cldn34c1Q8K193 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Cldn34c1Q8K193 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Cldn34c1Q8K193 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34c1Q8K193 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34c1Q8K193 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34c1Q8K193 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Cldn34c1Q8K193 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Cldn34c1Q8K193 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Cldn34c1Q8K193 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Cldn34c1Q8K193 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Cldn34c1Q8K193 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Cldn34c1Q8K193 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Cldn34c1Q8K193 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms