Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkn3Q8K045 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Pkn3Q8K045 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Pkn3Q8K045 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkn3Q8K045 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkn3Q8K045 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkn3Q8K045 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Pkn3Q8K045 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Pkn3Q8K045 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Pkn3Q8K045 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkn3Q8K045 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkn3Q8K045 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkn3Q8K045 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Pkn3Q8K045 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Pkn3Q8K045 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkn3Q8K045 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
Pkn3Q8K045 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkn3Q8K045 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Pkn3Q8K045 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkn3Q8K045 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Pkn3Q8K045 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Pkn3Q8K045 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkn3Q8K045 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Pkn3Q8K045 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkn3Q8K045 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkn3Q8K045 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Pkn3Q8K045 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Pkn3Q8K045 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkn3Q8K045 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Pkn3Q8K045 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Pkn3Q8K045 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkn3Q8K045 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Pkn3Q8K045 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkn3Q8K045 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkn3Q8K045 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Pkn3Q8K045 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkn3Q8K045 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Pkn3Q8K045 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Pkn3Q8K045 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkn3Q8K045 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Pkn3Q8K045 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Pkn3Q8K045 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkn3Q8K045 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkn3Q8K045 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pkn3Q8K045 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkn3Q8K045 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkn3Q8K045 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pkn3Q8K045 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pkn3Q8K045 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pkn3Q8K045 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkn3Q8K045 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkn3Q8K045 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Pkn3Q8K045 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Pkn3Q8K045 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pkn3Q8K045 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pkn3Q8K045 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Pkn3Q8K045 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkn3Q8K045 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkn3Q8K045 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pkn3Q8K045 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pkn3Q8K045 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkn3Q8K045 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkn3Q8K045 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkn3Q8K045 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Pkn3Q8K045 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkn3Q8K045 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkn3Q8K045 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pkn3Q8K045 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pkn3Q8K045 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pkn3Q8K045 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pkn3Q8K045 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pkn3Q8K045 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pkn3Q8K045 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pkn3Q8K045 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms