Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZR4

Slc1a7, Excitatory amino acid transporter 5, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a7Q8JZR4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a7Q8JZR4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a7Q8JZR4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc1a7Q8JZR4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a7Q8JZR4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Slc1a7Q8JZR4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Slc1a7Q8JZR4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc1a7Q8JZR4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Slc1a7Q8JZR4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc1a7Q8JZR4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc1a7Q8JZR4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Slc1a7Q8JZR4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a7Q8JZR4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Slc1a7Q8JZR4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Slc1a7Q8JZR4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Slc1a7Q8JZR4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Slc1a7Q8JZR4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Slc1a7Q8JZR4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Slc1a7Q8JZR4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Slc1a7Q8JZR4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Slc1a7Q8JZR4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc1a7Q8JZR4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc1a7Q8JZR4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Slc1a7Q8JZR4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Slc1a7Q8JZR4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc1a7Q8JZR4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Slc1a7Q8JZR4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a7Q8JZR4 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a7Q8JZR4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Slc1a7Q8JZR4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Slc1a7Q8JZR4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Slc1a7Q8JZR4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a7Q8JZR4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Slc1a7Q8JZR4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Slc1a7Q8JZR4 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a7Q8JZR4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a7Q8JZR4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Slc1a7Q8JZR4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms