Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trip10Q8CJ53 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trip10Q8CJ53 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trip10Q8CJ53 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trip10Q8CJ53 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Trip10Q8CJ53 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trip10Q8CJ53 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trip10Q8CJ53 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trip10Q8CJ53 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trip10Q8CJ53 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trip10Q8CJ53 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Trip10Q8CJ53 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trip10Q8CJ53 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trip10Q8CJ53 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip10Q8CJ53 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip10Q8CJ53 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Trip10Q8CJ53 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trip10Q8CJ53 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trip10Q8CJ53 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Trip10Q8CJ53 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trip10Q8CJ53 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trip10Q8CJ53 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Trip10Q8CJ53 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Trip10Q8CJ53 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trip10Q8CJ53 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trip10Q8CJ53 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trip10Q8CJ53 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trip10Q8CJ53 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trip10Q8CJ53 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trip10Q8CJ53 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trip10Q8CJ53 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trip10Q8CJ53 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trip10Q8CJ53 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trip10Q8CJ53 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trip10Q8CJ53 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trip10Q8CJ53 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trip10Q8CJ53 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trip10Q8CJ53 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trip10Q8CJ53 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trip10Q8CJ53 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip10Q8CJ53 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trip10Q8CJ53 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trip10Q8CJ53 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trip10Q8CJ53 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Trip10Q8CJ53 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Trip10Q8CJ53 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Trip10Q8CJ53 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Trip10Q8CJ53 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Trip10Q8CJ53 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trip10Q8CJ53 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Trip10Q8CJ53 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trip10Q8CJ53 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Trip10Q8CJ53 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Trip10Q8CJ53 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Trip10Q8CJ53 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
Trip10Q8CJ53 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Trip10Q8CJ53 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trip10Q8CJ53 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Trip10Q8CJ53 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trip10Q8CJ53 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trip10Q8CJ53 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Trip10Q8CJ53 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trip10Q8CJ53 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trip10Q8CJ53 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Trip10Q8CJ53 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Trip10Q8CJ53 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.39■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Trip10Q8CJ53 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms