Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIS0

Card11, Caspase recruitment domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Card11Q8CIS0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Card11Q8CIS0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Card11Q8CIS0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Card11Q8CIS0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,98■■■■□ 3,35
Card11Q8CIS0 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,97■■■■□ 3,35
Card11Q8CIS0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,94■■■■□ 3,34
Card11Q8CIS0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Card11Q8CIS0 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Card11Q8CIS0 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC35,93■■■■□ 3,34
Card11Q8CIS0 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,92■■■■□ 3,34
Card11Q8CIS0 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Card11Q8CIS0 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC35,91■■■■□ 3,34
Card11Q8CIS0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Card11Q8CIS0 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,9■■■■□ 3,34
Card11Q8CIS0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC35,88■■■■□ 3,33
Card11Q8CIS0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC35,87■■■■□ 3,33
Card11Q8CIS0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,86■■■■□ 3,33
Card11Q8CIS0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,85■■■■□ 3,33
Card11Q8CIS0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35,85■■■■□ 3,33
Card11Q8CIS0 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,83■■■■□ 3,33
Card11Q8CIS0 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,81■■■■□ 3,32
Card11Q8CIS0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,8■■■■□ 3,32
Card11Q8CIS0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,76■■■■□ 3,32
Card11Q8CIS0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC35,76■■■■□ 3,31
Card11Q8CIS0 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC35,73■■■■□ 3,31
Card11Q8CIS0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC35,72■■■■□ 3,31
Card11Q8CIS0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,71■■■■□ 3,31
Card11Q8CIS0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Card11Q8CIS0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC35,7■■■■□ 3,31
Card11Q8CIS0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,7■■■■□ 3,31
Card11Q8CIS0 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC35,68■■■■□ 3,3
Card11Q8CIS0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,68■■■■□ 3,3
Card11Q8CIS0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Card11Q8CIS0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,67■■■■□ 3,3
Card11Q8CIS0 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,66■■■■□ 3,3
Card11Q8CIS0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Card11Q8CIS0 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC35,62■■■■□ 3,29
Card11Q8CIS0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,61■■■■□ 3,29
Card11Q8CIS0 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC35,6■■■■□ 3,29
Card11Q8CIS0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,6■■■■□ 3,29
Card11Q8CIS0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,58■■■■□ 3,29
Card11Q8CIS0 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,57■■■■□ 3,28
Card11Q8CIS0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,56■■■■□ 3,28
Card11Q8CIS0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35,56■■■■□ 3,28
Card11Q8CIS0 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,54■■■■□ 3,28
Card11Q8CIS0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,53■■■■□ 3,28
Card11Q8CIS0 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC35,51■■■■□ 3,28
Card11Q8CIS0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC35,5■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,5■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC35,49■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC35,49■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35,48■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC35,48■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC35,47■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC35,46■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,45■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC35,45■■■■□ 3,27
Card11Q8CIS0 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC35,44■■■■□ 3,26
Card11Q8CIS0 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,44■■■■□ 3,26
Card11Q8CIS0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Card11Q8CIS0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Card11Q8CIS0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC35,43■■■■□ 3,26
Card11Q8CIS0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,42■■■■□ 3,26
Card11Q8CIS0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35,42■■■■□ 3,26
Card11Q8CIS0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC35,41■■■■□ 3,26
Card11Q8CIS0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC35,41■■■■□ 3,26
Card11Q8CIS0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35,39■■■■□ 3,26
Card11Q8CIS0 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Card11Q8CIS0 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC35,38■■■■□ 3,25
Card11Q8CIS0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,38■■■■□ 3,25
Card11Q8CIS0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Card11Q8CIS0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,37■■■■□ 3,25
Card11Q8CIS0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC35,36■■■■□ 3,25
Card11Q8CIS0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,36■■■■□ 3,25
Card11Q8CIS0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC35,35■■■■□ 3,25
Card11Q8CIS0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35,34■■■■□ 3,25
Card11Q8CIS0 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC35,33■■■■□ 3,25
Card11Q8CIS0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC35,33■■■■□ 3,25
Card11Q8CIS0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Card11Q8CIS0 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC35,32■■■■□ 3,24
Card11Q8CIS0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35,32■■■■□ 3,24
Card11Q8CIS0 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35,31■■■■□ 3,24
Card11Q8CIS0 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,26■■■■□ 3,24
Card11Q8CIS0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC35,24■■■■□ 3,23
Card11Q8CIS0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC35,23■■■■□ 3,23
Card11Q8CIS0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Card11Q8CIS0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC35,22■■■■□ 3,23
Card11Q8CIS0 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,22■■■■□ 3,23
Card11Q8CIS0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Card11Q8CIS0 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,23
Card11Q8CIS0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,22
Card11Q8CIS0 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35,2■■■■□ 3,22
Card11Q8CIS0 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Card11Q8CIS0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC35,19■■■■□ 3,22
Card11Q8CIS0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35,19■■■■□ 3,22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11,9 ms