Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDV6

Ccdc63, Coiled-coil domain-containing protein 63, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc63Q8CDV6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ccdc63Q8CDV6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25,54■■□□□ 1,68
Ccdc63Q8CDV6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Ccdc63Q8CDV6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Ccdc63Q8CDV6 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Ccdc63Q8CDV6 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Ccdc63Q8CDV6 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Ccdc63Q8CDV6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccdc63Q8CDV6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Ccdc63Q8CDV6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccdc63Q8CDV6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Ccdc63Q8CDV6 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,43■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25,41■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25,39■■□□□ 1,66
Ccdc63Q8CDV6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Ccdc63Q8CDV6 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,65
Ccdc63Q8CDV6 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Ccdc63Q8CDV6 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Ccdc63Q8CDV6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Ccdc63Q8CDV6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Ccdc63Q8CDV6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccdc63Q8CDV6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Ccdc63Q8CDV6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,28■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,27■■□□□ 1,64
Ccdc63Q8CDV6 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc63Q8CDV6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,26■■□□□ 1,63
Ccdc63Q8CDV6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ccdc63Q8CDV6 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ccdc63Q8CDV6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,25■■□□□ 1,63
Ccdc63Q8CDV6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,24■■□□□ 1,63
Ccdc63Q8CDV6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,23■■□□□ 1,63
Ccdc63Q8CDV6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc63Q8CDV6 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc63Q8CDV6 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc63Q8CDV6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25,22■■□□□ 1,63
Ccdc63Q8CDV6 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,21■■□□□ 1,63
Ccdc63Q8CDV6 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,2■■□□□ 1,62
Ccdc63Q8CDV6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,2■■□□□ 1,62
Ccdc63Q8CDV6 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,19■■□□□ 1,62
Ccdc63Q8CDV6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc63Q8CDV6 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc63Q8CDV6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25,18■■□□□ 1,62
Ccdc63Q8CDV6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ccdc63Q8CDV6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25,17■■□□□ 1,62
Ccdc63Q8CDV6 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25,17■■□□□ 1,62
Ccdc63Q8CDV6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ccdc63Q8CDV6 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,15■■□□□ 1,62
Ccdc63Q8CDV6 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ccdc63Q8CDV6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,13■■□□□ 1,61
Ccdc63Q8CDV6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ccdc63Q8CDV6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ccdc63Q8CDV6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ccdc63Q8CDV6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25,12■■□□□ 1,61
Ccdc63Q8CDV6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,11■■□□□ 1,61
Ccdc63Q8CDV6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ccdc63Q8CDV6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,1■■□□□ 1,61
Ccdc63Q8CDV6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ccdc63Q8CDV6 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,09■■□□□ 1,61
Ccdc63Q8CDV6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25,08■■□□□ 1,61
Ccdc63Q8CDV6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,06■■□□□ 1,6
Ccdc63Q8CDV6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,04■■□□□ 1,6
Ccdc63Q8CDV6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ccdc63Q8CDV6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,03■■□□□ 1,6
Ccdc63Q8CDV6 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,02■■□□□ 1,6
Ccdc63Q8CDV6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25,02■■□□□ 1,6
Ccdc63Q8CDV6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Ccdc63Q8CDV6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Ccdc63Q8CDV6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,01■■□□□ 1,59
Ccdc63Q8CDV6 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Ccdc63Q8CDV6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1,59
Ccdc63Q8CDV6 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Ccdc63Q8CDV6 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Ccdc63Q8CDV6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24,99■■□□□ 1,59
Ccdc63Q8CDV6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24,98■■□□□ 1,59
Ccdc63Q8CDV6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Ccdc63Q8CDV6 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Ccdc63Q8CDV6 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24,98■■□□□ 1,59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72,9 ms