Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDM1

Atad2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atad2Q8CDM1 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30,14■■■□□ 2,41
Atad2Q8CDM1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC30,13■■■□□ 2,41
Atad2Q8CDM1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Atad2Q8CDM1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,12■■■□□ 2,41
Atad2Q8CDM1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,11■■■□□ 2,41
Atad2Q8CDM1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Atad2Q8CDM1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC30,09■■■□□ 2,41
Atad2Q8CDM1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Atad2Q8CDM1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30,08■■■□□ 2,41
Atad2Q8CDM1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Atad2Q8CDM1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30,07■■■□□ 2,4
Atad2Q8CDM1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC30,05■■■□□ 2,4
Atad2Q8CDM1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,05■■■□□ 2,4
Atad2Q8CDM1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Atad2Q8CDM1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30,04■■■□□ 2,4
Atad2Q8CDM1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Atad2Q8CDM1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC30,03■■■□□ 2,4
Atad2Q8CDM1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC30,03■■■□□ 2,4
Atad2Q8CDM1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Atad2Q8CDM1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30,02■■■□□ 2,4
Atad2Q8CDM1 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30,02■■■□□ 2,4
Atad2Q8CDM1 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC30,01■■■□□ 2,39
Atad2Q8CDM1 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2,39
Atad2Q8CDM1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,98■■■□□ 2,39
Atad2Q8CDM1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,98■■■□□ 2,39
Atad2Q8CDM1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29,97■■■□□ 2,39
Atad2Q8CDM1 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC29,94■■■□□ 2,38
Atad2Q8CDM1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Atad2Q8CDM1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29,93■■■□□ 2,38
Atad2Q8CDM1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,92■■■□□ 2,38
Atad2Q8CDM1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC29,9■■■□□ 2,38
Atad2Q8CDM1 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC29,89■■■□□ 2,38
Atad2Q8CDM1 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Atad2Q8CDM1 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC29,86■■■□□ 2,37
Atad2Q8CDM1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29,86■■■□□ 2,37
Atad2Q8CDM1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC29,85■■■□□ 2,37
Atad2Q8CDM1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Atad2Q8CDM1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,84■■■□□ 2,37
Atad2Q8CDM1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Atad2Q8CDM1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC29,83■■■□□ 2,37
Atad2Q8CDM1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Atad2Q8CDM1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,83■■■□□ 2,37
Atad2Q8CDM1 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,81■■■□□ 2,36
Atad2Q8CDM1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,8■■■□□ 2,36
Atad2Q8CDM1 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,77■■■□□ 2,36
Atad2Q8CDM1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC29,77■■■□□ 2,36
Atad2Q8CDM1 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,36
Atad2Q8CDM1 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,76■■■□□ 2,35
Atad2Q8CDM1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,76■■■□□ 2,35
Atad2Q8CDM1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29,75■■■□□ 2,35
Atad2Q8CDM1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29,75■■■□□ 2,35
Atad2Q8CDM1 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,73■■■□□ 2,35
Atad2Q8CDM1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC29,72■■■□□ 2,35
Atad2Q8CDM1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29,72■■■□□ 2,35
Atad2Q8CDM1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,71■■■□□ 2,35
Atad2Q8CDM1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29,7■■■□□ 2,35
Atad2Q8CDM1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,68■■■□□ 2,34
Atad2Q8CDM1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Atad2Q8CDM1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,67■■■□□ 2,34
Atad2Q8CDM1 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Atad2Q8CDM1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,66■■■□□ 2,34
Atad2Q8CDM1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC29,65■■■□□ 2,34
Atad2Q8CDM1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Atad2Q8CDM1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC29,64■■■□□ 2,34
Atad2Q8CDM1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,64■■■□□ 2,34
Atad2Q8CDM1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Atad2Q8CDM1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,63■■■□□ 2,33
Atad2Q8CDM1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC29,63■■■□□ 2,33
Atad2Q8CDM1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC29,62■■■□□ 2,33
Atad2Q8CDM1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,62■■■□□ 2,33
Atad2Q8CDM1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Atad2Q8CDM1 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Atad2Q8CDM1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC29,61■■■□□ 2,33
Atad2Q8CDM1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC29,61■■■□□ 2,33
Atad2Q8CDM1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29,6■■■□□ 2,33
Atad2Q8CDM1 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29,59■■■□□ 2,33
Atad2Q8CDM1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC29,58■■■□□ 2,33
Atad2Q8CDM1 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,57■■■□□ 2,32
Atad2Q8CDM1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Atad2Q8CDM1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC29,55■■■□□ 2,32
Atad2Q8CDM1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Atad2Q8CDM1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,55■■■□□ 2,32
Atad2Q8CDM1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC29,54■■■□□ 2,32
Atad2Q8CDM1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,54■■■□□ 2,32
Atad2Q8CDM1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC29,53■■■□□ 2,32
Atad2Q8CDM1 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29,51■■■□□ 2,31
Atad2Q8CDM1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Atad2Q8CDM1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29,5■■■□□ 2,31
Atad2Q8CDM1 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,49■■■□□ 2,31
Atad2Q8CDM1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29,48■■■□□ 2,31
Atad2Q8CDM1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Atad2Q8CDM1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Atad2Q8CDM1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Atad2Q8CDM1 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,47■■■□□ 2,31
Atad2Q8CDM1 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29,46■■■□□ 2,31
Atad2Q8CDM1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,45■■■□□ 2,3
Atad2Q8CDM1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29,44■■■□□ 2,3
Atad2Q8CDM1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Atad2Q8CDM1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29,43■■■□□ 2,3
Atad2Q8CDM1 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29,43■■■□□ 2,3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10,8 ms