Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCE9

E4f1, Transcription factor E4F1, mousemouse

Predictions only

Length 783 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E4f1Q8CCE9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC29.94■■■□□ 2.38
E4f1Q8CCE9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
E4f1Q8CCE9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
E4f1Q8CCE9 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
E4f1Q8CCE9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
E4f1Q8CCE9 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
E4f1Q8CCE9 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
E4f1Q8CCE9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E4f1Q8CCE9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
E4f1Q8CCE9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E4f1Q8CCE9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
E4f1Q8CCE9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
E4f1Q8CCE9 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
E4f1Q8CCE9 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
E4f1Q8CCE9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
E4f1Q8CCE9 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
E4f1Q8CCE9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
E4f1Q8CCE9 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
E4f1Q8CCE9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
E4f1Q8CCE9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC29.73■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
E4f1Q8CCE9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
E4f1Q8CCE9 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
E4f1Q8CCE9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
E4f1Q8CCE9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
E4f1Q8CCE9 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
E4f1Q8CCE9 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
E4f1Q8CCE9 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
E4f1Q8CCE9 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
E4f1Q8CCE9 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC29.64■■■□□ 2.34
E4f1Q8CCE9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
E4f1Q8CCE9 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
E4f1Q8CCE9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
E4f1Q8CCE9 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
E4f1Q8CCE9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
E4f1Q8CCE9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
E4f1Q8CCE9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
E4f1Q8CCE9 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
E4f1Q8CCE9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
E4f1Q8CCE9 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
E4f1Q8CCE9 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
E4f1Q8CCE9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
E4f1Q8CCE9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
E4f1Q8CCE9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
E4f1Q8CCE9 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
E4f1Q8CCE9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC29.53■■■□□ 2.32
E4f1Q8CCE9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
E4f1Q8CCE9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.49■■■□□ 2.31
E4f1Q8CCE9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
E4f1Q8CCE9 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
E4f1Q8CCE9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
E4f1Q8CCE9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
E4f1Q8CCE9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.48■■■□□ 2.31
E4f1Q8CCE9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
E4f1Q8CCE9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
E4f1Q8CCE9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.43■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.42■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC29.42■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.4■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
E4f1Q8CCE9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.38■■■□□ 2.29
E4f1Q8CCE9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
E4f1Q8CCE9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
E4f1Q8CCE9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC29.36■■■□□ 2.29
E4f1Q8CCE9 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.36■■■□□ 2.29
E4f1Q8CCE9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC29.35■■■□□ 2.29
E4f1Q8CCE9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC29.35■■■□□ 2.29
E4f1Q8CCE9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.35■■■□□ 2.29
E4f1Q8CCE9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E4f1Q8CCE9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E4f1Q8CCE9 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
E4f1Q8CCE9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.34■■■□□ 2.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.7 ms