Protein–RNA interactions for Protein: Q8BW70

Usp38, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 38, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp38Q8BW70 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Usp38Q8BW70 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Usp38Q8BW70 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp38Q8BW70 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp38Q8BW70 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp38Q8BW70 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp38Q8BW70 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Usp38Q8BW70 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Usp38Q8BW70 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Usp38Q8BW70 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp38Q8BW70 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp38Q8BW70 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Usp38Q8BW70 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Usp38Q8BW70 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Usp38Q8BW70 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp38Q8BW70 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp38Q8BW70 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Usp38Q8BW70 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp38Q8BW70 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Usp38Q8BW70 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Usp38Q8BW70 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Usp38Q8BW70 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Usp38Q8BW70 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
Usp38Q8BW70 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
Usp38Q8BW70 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Usp38Q8BW70 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp38Q8BW70 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Usp38Q8BW70 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
Usp38Q8BW70 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
Usp38Q8BW70 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Usp38Q8BW70 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Usp38Q8BW70 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Usp38Q8BW70 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Usp38Q8BW70 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms