Protein–RNA interactions for Protein: Q8BUJ9

Lrp12, Low-density lipoprotein receptor-related protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp12Q8BUJ9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp12Q8BUJ9 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Lrp12Q8BUJ9 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Lrp12Q8BUJ9 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrp12Q8BUJ9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Lrp12Q8BUJ9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrp12Q8BUJ9 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrp12Q8BUJ9 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Lrp12Q8BUJ9 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Lrp12Q8BUJ9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp12Q8BUJ9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Lrp12Q8BUJ9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Lrp12Q8BUJ9 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrp12Q8BUJ9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Lrp12Q8BUJ9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp12Q8BUJ9 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp12Q8BUJ9 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Lrp12Q8BUJ9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp12Q8BUJ9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Lrp12Q8BUJ9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp12Q8BUJ9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Lrp12Q8BUJ9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Lrp12Q8BUJ9 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lrp12Q8BUJ9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lrp12Q8BUJ9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Lrp12Q8BUJ9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp12Q8BUJ9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Lrp12Q8BUJ9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp12Q8BUJ9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp12Q8BUJ9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Lrp12Q8BUJ9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Lrp12Q8BUJ9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp12Q8BUJ9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp12Q8BUJ9 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Lrp12Q8BUJ9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Lrp12Q8BUJ9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.5 ms