Protein–RNA interactions for Protein: Q8BSZ2

Ap3s2, AP-3 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s2Q8BSZ2 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3s2Q8BSZ2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ap3s2Q8BSZ2 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3s2Q8BSZ2 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3s2Q8BSZ2 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ap3s2Q8BSZ2 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3s2Q8BSZ2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3s2Q8BSZ2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ap3s2Q8BSZ2 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ap3s2Q8BSZ2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ap3s2Q8BSZ2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ap3s2Q8BSZ2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ap3s2Q8BSZ2 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Ap3s2Q8BSZ2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Ap3s2Q8BSZ2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.7 ms