Protein–RNA interactions for Protein: Q8BQ47

Cnpy4, Protein canopy homolog 4, mousemouse

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Length 245 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnpy4Q8BQ47 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnpy4Q8BQ47 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnpy4Q8BQ47 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Cnpy4Q8BQ47 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Cnpy4Q8BQ47 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnpy4Q8BQ47 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Cnpy4Q8BQ47 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Cnpy4Q8BQ47 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnpy4Q8BQ47 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnpy4Q8BQ47 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Cnpy4Q8BQ47 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnpy4Q8BQ47 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Cnpy4Q8BQ47 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnpy4Q8BQ47 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnpy4Q8BQ47 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnpy4Q8BQ47 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnpy4Q8BQ47 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Cnpy4Q8BQ47 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnpy4Q8BQ47 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Cnpy4Q8BQ47 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Cnpy4Q8BQ47 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Cnpy4Q8BQ47 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnpy4Q8BQ47 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnpy4Q8BQ47 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Cnpy4Q8BQ47 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Cnpy4Q8BQ47 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Cnpy4Q8BQ47 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnpy4Q8BQ47 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnpy4Q8BQ47 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cnpy4Q8BQ47 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cnpy4Q8BQ47 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cnpy4Q8BQ47 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnpy4Q8BQ47 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnpy4Q8BQ47 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnpy4Q8BQ47 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cnpy4Q8BQ47 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cnpy4Q8BQ47 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnpy4Q8BQ47 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cnpy4Q8BQ47 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.08■■□□□ 1.61
Cnpy4Q8BQ47 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cnpy4Q8BQ47 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cnpy4Q8BQ47 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnpy4Q8BQ47 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Cnpy4Q8BQ47 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnpy4Q8BQ47 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cnpy4Q8BQ47 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cnpy4Q8BQ47 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cnpy4Q8BQ47 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnpy4Q8BQ47 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnpy4Q8BQ47 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cnpy4Q8BQ47 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cnpy4Q8BQ47 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cnpy4Q8BQ47 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnpy4Q8BQ47 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnpy4Q8BQ47 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cnpy4Q8BQ47 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cnpy4Q8BQ47 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cnpy4Q8BQ47 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms