Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHW4

4933430I17Rik, RIKEN cDNA 4933430I17 gene, mousemouse

Predictions only

Length 495 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933430I17RikQ8BHW4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
4933430I17RikQ8BHW4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
4933430I17RikQ8BHW4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933430I17RikQ8BHW4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933430I17RikQ8BHW4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
4933430I17RikQ8BHW4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
4933430I17RikQ8BHW4 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
4933430I17RikQ8BHW4 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
4933430I17RikQ8BHW4 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
4933430I17RikQ8BHW4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
4933430I17RikQ8BHW4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
4933430I17RikQ8BHW4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
4933430I17RikQ8BHW4 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933430I17RikQ8BHW4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
4933430I17RikQ8BHW4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
4933430I17RikQ8BHW4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
4933430I17RikQ8BHW4 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933430I17RikQ8BHW4 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933430I17RikQ8BHW4 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
4933430I17RikQ8BHW4 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
4933430I17RikQ8BHW4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
4933430I17RikQ8BHW4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933430I17RikQ8BHW4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
4933430I17RikQ8BHW4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
4933430I17RikQ8BHW4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
4933430I17RikQ8BHW4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
4933430I17RikQ8BHW4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933430I17RikQ8BHW4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
4933430I17RikQ8BHW4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933430I17RikQ8BHW4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
4933430I17RikQ8BHW4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933430I17RikQ8BHW4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933430I17RikQ8BHW4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933430I17RikQ8BHW4 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
4933430I17RikQ8BHW4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
4933430I17RikQ8BHW4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
4933430I17RikQ8BHW4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
4933430I17RikQ8BHW4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
4933430I17RikQ8BHW4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933430I17RikQ8BHW4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
4933430I17RikQ8BHW4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933430I17RikQ8BHW4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
4933430I17RikQ8BHW4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933430I17RikQ8BHW4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
4933430I17RikQ8BHW4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933430I17RikQ8BHW4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
4933430I17RikQ8BHW4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
4933430I17RikQ8BHW4 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933430I17RikQ8BHW4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
4933430I17RikQ8BHW4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
4933430I17RikQ8BHW4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
4933430I17RikQ8BHW4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933430I17RikQ8BHW4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933430I17RikQ8BHW4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
4933430I17RikQ8BHW4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
4933430I17RikQ8BHW4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 79.2 ms