Protein–RNA interactions for Protein: Q8BHH8

Clrn3, Clarin-3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clrn3Q8BHH8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,57■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,57■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23,56■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23,55■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23,55■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23,54■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,54■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23,54■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23,53■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23,53■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,52■■□□□ 1,36
Clrn3Q8BHH8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,51■■□□□ 1,35
Clrn3Q8BHH8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,5■■□□□ 1,35
Clrn3Q8BHH8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23,49■■□□□ 1,35
Clrn3Q8BHH8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,49■■□□□ 1,35
Clrn3Q8BHH8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23,47■■□□□ 1,35
Clrn3Q8BHH8 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,47■■□□□ 1,35
Clrn3Q8BHH8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,46■■□□□ 1,35
Clrn3Q8BHH8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,43■■□□□ 1,34
Clrn3Q8BHH8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23,42■■□□□ 1,34
Clrn3Q8BHH8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,41■■□□□ 1,34
Clrn3Q8BHH8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Clrn3Q8BHH8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,4■■□□□ 1,34
Clrn3Q8BHH8 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Clrn3Q8BHH8 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Clrn3Q8BHH8 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Clrn3Q8BHH8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,34
Clrn3Q8BHH8 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23,39■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23,39■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,39■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,37■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,37■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23,36■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23,36■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,35■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,34■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23,33■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23,33■■□□□ 1,33
Clrn3Q8BHH8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Clrn3Q8BHH8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Clrn3Q8BHH8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,32■■□□□ 1,32
Clrn3Q8BHH8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23,31■■□□□ 1,32
Clrn3Q8BHH8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Clrn3Q8BHH8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,3■■□□□ 1,32
Clrn3Q8BHH8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,29■■□□□ 1,32
Clrn3Q8BHH8 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Clrn3Q8BHH8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23,27■■□□□ 1,32
Clrn3Q8BHH8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23,26■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23,26■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23,25■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23,25■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,24■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23,23■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23,22■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,22■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,22■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23,21■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23,21■■□□□ 1,31
Clrn3Q8BHH8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,2■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23,19■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,19■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23,18■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23,16■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,15■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23,15■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23,15■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23,14■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,3
Clrn3Q8BHH8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,14■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23,13■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,12■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23,11■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23,11■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,1■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23,09■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23,09■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23,08■■□□□ 1,29
Clrn3Q8BHH8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23,08■■□□□ 1,28
Clrn3Q8BHH8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23,07■■□□□ 1,28
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