Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGW1

Fto, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase FTO, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FtoQ8BGW1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FtoQ8BGW1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FtoQ8BGW1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FtoQ8BGW1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
FtoQ8BGW1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FtoQ8BGW1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FtoQ8BGW1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FtoQ8BGW1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FtoQ8BGW1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.74■■■□□ 2.03
FtoQ8BGW1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FtoQ8BGW1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FtoQ8BGW1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FtoQ8BGW1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FtoQ8BGW1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FtoQ8BGW1 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FtoQ8BGW1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FtoQ8BGW1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FtoQ8BGW1 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
FtoQ8BGW1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FtoQ8BGW1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FtoQ8BGW1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC27.65■■■□□ 2.02
FtoQ8BGW1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FtoQ8BGW1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
FtoQ8BGW1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
FtoQ8BGW1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FtoQ8BGW1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FtoQ8BGW1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FtoQ8BGW1 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FtoQ8BGW1 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FtoQ8BGW1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
FtoQ8BGW1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FtoQ8BGW1 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FtoQ8BGW1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FtoQ8BGW1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2
FtoQ8BGW1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FtoQ8BGW1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FtoQ8BGW1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
FtoQ8BGW1 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
FtoQ8BGW1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
FtoQ8BGW1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
FtoQ8BGW1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC27.53■■■□□ 2
FtoQ8BGW1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
FtoQ8BGW1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
FtoQ8BGW1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
FtoQ8BGW1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FtoQ8BGW1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
FtoQ8BGW1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
FtoQ8BGW1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
FtoQ8BGW1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
FtoQ8BGW1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
FtoQ8BGW1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
FtoQ8BGW1 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
FtoQ8BGW1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
FtoQ8BGW1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
FtoQ8BGW1 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FtoQ8BGW1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FtoQ8BGW1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FtoQ8BGW1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
FtoQ8BGW1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
FtoQ8BGW1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FtoQ8BGW1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FtoQ8BGW1 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FtoQ8BGW1 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FtoQ8BGW1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FtoQ8BGW1 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FtoQ8BGW1 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FtoQ8BGW1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
FtoQ8BGW1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.96
FtoQ8BGW1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC27.26■■□□□ 1.95
FtoQ8BGW1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FtoQ8BGW1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FtoQ8BGW1 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FtoQ8BGW1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FtoQ8BGW1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FtoQ8BGW1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FtoQ8BGW1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FtoQ8BGW1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FtoQ8BGW1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FtoQ8BGW1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FtoQ8BGW1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FtoQ8BGW1 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
FtoQ8BGW1 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FtoQ8BGW1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FtoQ8BGW1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FtoQ8BGW1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms