Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGQ1

Vipas39, Spermatogenesis-defective protein 39 homolog, mousemouse

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Length 491 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vipas39Q8BGQ1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Vipas39Q8BGQ1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Vipas39Q8BGQ1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vipas39Q8BGQ1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Vipas39Q8BGQ1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Vipas39Q8BGQ1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Vipas39Q8BGQ1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Vipas39Q8BGQ1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vipas39Q8BGQ1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Vipas39Q8BGQ1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Vipas39Q8BGQ1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vipas39Q8BGQ1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Vipas39Q8BGQ1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vipas39Q8BGQ1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Vipas39Q8BGQ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vipas39Q8BGQ1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vipas39Q8BGQ1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Vipas39Q8BGQ1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
Vipas39Q8BGQ1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Vipas39Q8BGQ1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Vipas39Q8BGQ1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vipas39Q8BGQ1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Vipas39Q8BGQ1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Vipas39Q8BGQ1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vipas39Q8BGQ1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vipas39Q8BGQ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Vipas39Q8BGQ1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vipas39Q8BGQ1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Vipas39Q8BGQ1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Vipas39Q8BGQ1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vipas39Q8BGQ1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vipas39Q8BGQ1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Vipas39Q8BGQ1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Vipas39Q8BGQ1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Vipas39Q8BGQ1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vipas39Q8BGQ1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Vipas39Q8BGQ1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Vipas39Q8BGQ1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vipas39Q8BGQ1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Vipas39Q8BGQ1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vipas39Q8BGQ1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vipas39Q8BGQ1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Vipas39Q8BGQ1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Vipas39Q8BGQ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vipas39Q8BGQ1 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
Vipas39Q8BGQ1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Vipas39Q8BGQ1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
Vipas39Q8BGQ1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Vipas39Q8BGQ1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Vipas39Q8BGQ1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Vipas39Q8BGQ1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Vipas39Q8BGQ1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vipas39Q8BGQ1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vipas39Q8BGQ1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vipas39Q8BGQ1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vipas39Q8BGQ1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vipas39Q8BGQ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Vipas39Q8BGQ1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Vipas39Q8BGQ1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Vipas39Q8BGQ1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Vipas39Q8BGQ1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vipas39Q8BGQ1 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Vipas39Q8BGQ1 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Vipas39Q8BGQ1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Vipas39Q8BGQ1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vipas39Q8BGQ1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Vipas39Q8BGQ1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Vipas39Q8BGQ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Vipas39Q8BGQ1 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vipas39Q8BGQ1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Vipas39Q8BGQ1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Vipas39Q8BGQ1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Vipas39Q8BGQ1 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Vipas39Q8BGQ1 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Vipas39Q8BGQ1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Vipas39Q8BGQ1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vipas39Q8BGQ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vipas39Q8BGQ1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Vipas39Q8BGQ1 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vipas39Q8BGQ1 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vipas39Q8BGQ1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vipas39Q8BGQ1 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vipas39Q8BGQ1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Vipas39Q8BGQ1 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
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