Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG28

B3galnt2, UDP-GalNAc:beta-1,3-N-acetylgalactosaminyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3galnt2Q8BG28 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
B3galnt2Q8BG28 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
B3galnt2Q8BG28 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
B3galnt2Q8BG28 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
B3galnt2Q8BG28 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
B3galnt2Q8BG28 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
B3galnt2Q8BG28 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
B3galnt2Q8BG28 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
B3galnt2Q8BG28 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
B3galnt2Q8BG28 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
B3galnt2Q8BG28 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B3galnt2Q8BG28 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
B3galnt2Q8BG28 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
B3galnt2Q8BG28 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
B3galnt2Q8BG28 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
B3galnt2Q8BG28 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
B3galnt2Q8BG28 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
B3galnt2Q8BG28 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
B3galnt2Q8BG28 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
B3galnt2Q8BG28 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
B3galnt2Q8BG28 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
B3galnt2Q8BG28 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B3galnt2Q8BG28 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
B3galnt2Q8BG28 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B3galnt2Q8BG28 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
B3galnt2Q8BG28 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
B3galnt2Q8BG28 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B3galnt2Q8BG28 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
B3galnt2Q8BG28 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
B3galnt2Q8BG28 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
B3galnt2Q8BG28 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
B3galnt2Q8BG28 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
B3galnt2Q8BG28 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
B3galnt2Q8BG28 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
B3galnt2Q8BG28 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
B3galnt2Q8BG28 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B3galnt2Q8BG28 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
B3galnt2Q8BG28 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
B3galnt2Q8BG28 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
B3galnt2Q8BG28 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
B3galnt2Q8BG28 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
B3galnt2Q8BG28 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B3galnt2Q8BG28 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
B3galnt2Q8BG28 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
B3galnt2Q8BG28 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B3galnt2Q8BG28 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B3galnt2Q8BG28 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
B3galnt2Q8BG28 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B3galnt2Q8BG28 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B3galnt2Q8BG28 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
B3galnt2Q8BG28 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
B3galnt2Q8BG28 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
B3galnt2Q8BG28 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
B3galnt2Q8BG28 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
B3galnt2Q8BG28 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
B3galnt2Q8BG28 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
B3galnt2Q8BG28 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B3galnt2Q8BG28 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
B3galnt2Q8BG28 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
B3galnt2Q8BG28 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
B3galnt2Q8BG28 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
B3galnt2Q8BG28 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
B3galnt2Q8BG28 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B3galnt2Q8BG28 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
B3galnt2Q8BG28 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B3galnt2Q8BG28 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
B3galnt2Q8BG28 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
B3galnt2Q8BG28 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
B3galnt2Q8BG28 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
B3galnt2Q8BG28 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
B3galnt2Q8BG28 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B3galnt2Q8BG28 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
B3galnt2Q8BG28 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
B3galnt2Q8BG28 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B3galnt2Q8BG28 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B3galnt2Q8BG28 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
B3galnt2Q8BG28 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
B3galnt2Q8BG28 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
B3galnt2Q8BG28 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B3galnt2Q8BG28 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
B3galnt2Q8BG28 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
B3galnt2Q8BG28 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.07■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
B3galnt2Q8BG28 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B3galnt2Q8BG28 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
B3galnt2Q8BG28 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B3galnt2Q8BG28 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B3galnt2Q8BG28 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
B3galnt2Q8BG28 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms