Protein–RNA interactions for Protein: Q810U3

Nfasc, Neurofascin, mousemouse

Predictions only

Length 1,240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfascQ810U3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
NfascQ810U3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
NfascQ810U3 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
NfascQ810U3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
NfascQ810U3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
NfascQ810U3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
NfascQ810U3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
NfascQ810U3 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
NfascQ810U3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NfascQ810U3 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
NfascQ810U3 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
NfascQ810U3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NfascQ810U3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NfascQ810U3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
NfascQ810U3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
NfascQ810U3 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
NfascQ810U3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
NfascQ810U3 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NfascQ810U3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.49■■□□□ 1.67
NfascQ810U3 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
NfascQ810U3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NfascQ810U3 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
NfascQ810U3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
NfascQ810U3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NfascQ810U3 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NfascQ810U3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NfascQ810U3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NfascQ810U3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NfascQ810U3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NfascQ810U3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NfascQ810U3 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NfascQ810U3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NfascQ810U3 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NfascQ810U3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NfascQ810U3 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfascQ810U3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfascQ810U3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfascQ810U3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NfascQ810U3 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NfascQ810U3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NfascQ810U3 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfascQ810U3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NfascQ810U3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfascQ810U3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfascQ810U3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfascQ810U3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
NfascQ810U3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NfascQ810U3 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
NfascQ810U3 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NfascQ810U3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfascQ810U3 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfascQ810U3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NfascQ810U3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NfascQ810U3 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NfascQ810U3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NfascQ810U3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NfascQ810U3 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NfascQ810U3 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NfascQ810U3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NfascQ810U3 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NfascQ810U3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms