Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z96

Vangl1, Vang-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vangl1Q80Z96 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Vangl1Q80Z96 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vangl1Q80Z96 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vangl1Q80Z96 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Vangl1Q80Z96 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Vangl1Q80Z96 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vangl1Q80Z96 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vangl1Q80Z96 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Vangl1Q80Z96 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Vangl1Q80Z96 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Vangl1Q80Z96 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Vangl1Q80Z96 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Vangl1Q80Z96 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Vangl1Q80Z96 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vangl1Q80Z96 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Vangl1Q80Z96 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Vangl1Q80Z96 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Vangl1Q80Z96 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Vangl1Q80Z96 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vangl1Q80Z96 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vangl1Q80Z96 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Vangl1Q80Z96 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vangl1Q80Z96 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vangl1Q80Z96 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Vangl1Q80Z96 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Vangl1Q80Z96 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vangl1Q80Z96 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Vangl1Q80Z96 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vangl1Q80Z96 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Vangl1Q80Z96 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Vangl1Q80Z96 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vangl1Q80Z96 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vangl1Q80Z96 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vangl1Q80Z96 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Vangl1Q80Z96 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vangl1Q80Z96 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vangl1Q80Z96 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Vangl1Q80Z96 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Vangl1Q80Z96 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Vangl1Q80Z96 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Vangl1Q80Z96 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Vangl1Q80Z96 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vangl1Q80Z96 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Vangl1Q80Z96 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vangl1Q80Z96 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vangl1Q80Z96 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Vangl1Q80Z96 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Vangl1Q80Z96 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Vangl1Q80Z96 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Vangl1Q80Z96 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vangl1Q80Z96 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Vangl1Q80Z96 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vangl1Q80Z96 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Vangl1Q80Z96 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vangl1Q80Z96 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vangl1Q80Z96 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vangl1Q80Z96 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vangl1Q80Z96 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Vangl1Q80Z96 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vangl1Q80Z96 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Vangl1Q80Z96 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.4 ms