Protein–RNA interactions for Protein: Q80Z71

Tnn, Tenascin-N, mousemouse

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TnnQ80Z71 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
TnnQ80Z71 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC43.66■■■■■ 4.58
TnnQ80Z71 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
TnnQ80Z71 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.64■■■■■ 4.58
TnnQ80Z71 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC43.63■■■■■ 4.57
TnnQ80Z71 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.59■■■■■ 4.57
TnnQ80Z71 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC43.59■■■■■ 4.57
TnnQ80Z71 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.58■■■■■ 4.57
TnnQ80Z71 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.57■■■■■ 4.57
TnnQ80Z71 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC43.57■■■■■ 4.57
TnnQ80Z71 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
TnnQ80Z71 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC43.55■■■■■ 4.56
TnnQ80Z71 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.54■■■■■ 4.56
TnnQ80Z71 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC43.53■■■■■ 4.56
TnnQ80Z71 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC43.53■■■■■ 4.56
TnnQ80Z71 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC43.5■■■■■ 4.55
TnnQ80Z71 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC43.49■■■■■ 4.55
TnnQ80Z71 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.48■■■■■ 4.55
TnnQ80Z71 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
TnnQ80Z71 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
TnnQ80Z71 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
TnnQ80Z71 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.42■■■■■ 4.54
TnnQ80Z71 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.41■■■■■ 4.54
TnnQ80Z71 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC43.4■■■■■ 4.54
TnnQ80Z71 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TnnQ80Z71 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TnnQ80Z71 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC43.39■■■■■ 4.54
TnnQ80Z71 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
TnnQ80Z71 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.54
TnnQ80Z71 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
TnnQ80Z71 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.38■■■■■ 4.53
TnnQ80Z71 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
TnnQ80Z71 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TnnQ80Z71 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC43.33■■■■■ 4.53
TnnQ80Z71 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
TnnQ80Z71 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
TnnQ80Z71 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC43.29■■■■■ 4.52
TnnQ80Z71 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC43.29■■■■■ 4.52
TnnQ80Z71 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
TnnQ80Z71 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC43.27■■■■■ 4.52
TnnQ80Z71 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.27■■■■■ 4.52
TnnQ80Z71 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.21■■■■■ 4.51
TnnQ80Z71 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC43.21■■■■■ 4.51
TnnQ80Z71 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.2■■■■■ 4.51
TnnQ80Z71 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC43.18■■■■■ 4.5
TnnQ80Z71 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.16■■■■■ 4.5
TnnQ80Z71 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
TnnQ80Z71 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC43.15■■■■■ 4.5
TnnQ80Z71 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.49
TnnQ80Z71 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
TnnQ80Z71 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
TnnQ80Z71 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
TnnQ80Z71 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
TnnQ80Z71 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.08■■■■■ 4.49
TnnQ80Z71 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
TnnQ80Z71 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.49
TnnQ80Z71 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC43.07■■■■■ 4.48
TnnQ80Z71 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
TnnQ80Z71 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
TnnQ80Z71 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
TnnQ80Z71 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.04■■■■■ 4.48
TnnQ80Z71 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC43.04■■■■■ 4.48
TnnQ80Z71 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.01■■■■■ 4.48
TnnQ80Z71 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.99■■■■■ 4.47
TnnQ80Z71 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TnnQ80Z71 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.97■■■■■ 4.47
TnnQ80Z71 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC42.96■■■■■ 4.47
TnnQ80Z71 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.92■■■■■ 4.46
TnnQ80Z71 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.9■■■■■ 4.46
TnnQ80Z71 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC42.88■■■■■ 4.46
TnnQ80Z71 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
TnnQ80Z71 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.84■■■■■ 4.45
TnnQ80Z71 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.83■■■■■ 4.45
TnnQ80Z71 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
TnnQ80Z71 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.81■■■■■ 4.44
TnnQ80Z71 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC42.79■■■■■ 4.44
TnnQ80Z71 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.79■■■■■ 4.44
TnnQ80Z71 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
TnnQ80Z71 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.73■■■■■ 4.43
TnnQ80Z71 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC42.73■■■■■ 4.43
TnnQ80Z71 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
TnnQ80Z71 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
TnnQ80Z71 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
TnnQ80Z71 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC42.68■■■■■ 4.42
TnnQ80Z71 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
TnnQ80Z71 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
TnnQ80Z71 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TnnQ80Z71 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC42.65■■■■■ 4.42
TnnQ80Z71 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
TnnQ80Z71 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.64■■■■■ 4.42
TnnQ80Z71 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
TnnQ80Z71 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
TnnQ80Z71 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC42.63■■■■■ 4.41
TnnQ80Z71 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
TnnQ80Z71 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.41
TnnQ80Z71 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC42.61■■■■■ 4.41
TnnQ80Z71 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC42.61■■■■■ 4.41
TnnQ80Z71 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
TnnQ80Z71 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
TnnQ80Z71 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC42.58■■■■■ 4.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms