Protein–RNA interactions for Protein: Q80XK6

Atg2b, Autophagy-related protein 2 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 2,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2bQ80XK6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Atg2bQ80XK6 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg2bQ80XK6 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Atg2bQ80XK6 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Atg2bQ80XK6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg2bQ80XK6 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Atg2bQ80XK6 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg2bQ80XK6 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Atg2bQ80XK6 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg2bQ80XK6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg2bQ80XK6 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg2bQ80XK6 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Atg2bQ80XK6 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg2bQ80XK6 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Atg2bQ80XK6 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Atg2bQ80XK6 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Atg2bQ80XK6 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg2bQ80XK6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Atg2bQ80XK6 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg2bQ80XK6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg2bQ80XK6 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Atg2bQ80XK6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg2bQ80XK6 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Atg2bQ80XK6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Atg2bQ80XK6 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
Atg2bQ80XK6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg2bQ80XK6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Atg2bQ80XK6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg2bQ80XK6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg2bQ80XK6 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg2bQ80XK6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Atg2bQ80XK6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg2bQ80XK6 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg2bQ80XK6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Atg2bQ80XK6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg2bQ80XK6 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Atg2bQ80XK6 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Atg2bQ80XK6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Atg2bQ80XK6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg2bQ80XK6 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Atg2bQ80XK6 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Atg2bQ80XK6 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atg2bQ80XK6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Atg2bQ80XK6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Atg2bQ80XK6 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Atg2bQ80XK6 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg2bQ80XK6 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg2bQ80XK6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg2bQ80XK6 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg2bQ80XK6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Atg2bQ80XK6 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Atg2bQ80XK6 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg2bQ80XK6 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Atg2bQ80XK6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Atg2bQ80XK6 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Atg2bQ80XK6 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Atg2bQ80XK6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Atg2bQ80XK6 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg2bQ80XK6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg2bQ80XK6 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg2bQ80XK6 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg2bQ80XK6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Atg2bQ80XK6 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Atg2bQ80XK6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Atg2bQ80XK6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg2bQ80XK6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg2bQ80XK6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Atg2bQ80XK6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Atg2bQ80XK6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Atg2bQ80XK6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Atg2bQ80XK6 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg2bQ80XK6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Atg2bQ80XK6 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7.1 ms