Protein–RNA interactions for Protein: Q80VM8

Pnma8a, Paraneoplastic antigen-like protein 8A, mousemouse

Predictions only

Length 430 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pnma8aQ80VM8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Pnma8aQ80VM8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pnma8aQ80VM8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Pnma8aQ80VM8 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Pnma8aQ80VM8 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pnma8aQ80VM8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Pnma8aQ80VM8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pnma8aQ80VM8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Pnma8aQ80VM8 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnma8aQ80VM8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnma8aQ80VM8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnma8aQ80VM8 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Pnma8aQ80VM8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Pnma8aQ80VM8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pnma8aQ80VM8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Pnma8aQ80VM8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnma8aQ80VM8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnma8aQ80VM8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnma8aQ80VM8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Pnma8aQ80VM8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Pnma8aQ80VM8 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pnma8aQ80VM8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pnma8aQ80VM8 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pnma8aQ80VM8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pnma8aQ80VM8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pnma8aQ80VM8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnma8aQ80VM8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnma8aQ80VM8 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pnma8aQ80VM8 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pnma8aQ80VM8 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pnma8aQ80VM8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pnma8aQ80VM8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pnma8aQ80VM8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pnma8aQ80VM8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pnma8aQ80VM8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pnma8aQ80VM8 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pnma8aQ80VM8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pnma8aQ80VM8 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pnma8aQ80VM8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pnma8aQ80VM8 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pnma8aQ80VM8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pnma8aQ80VM8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pnma8aQ80VM8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pnma8aQ80VM8 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnma8aQ80VM8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnma8aQ80VM8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnma8aQ80VM8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pnma8aQ80VM8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pnma8aQ80VM8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pnma8aQ80VM8 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pnma8aQ80VM8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Pnma8aQ80VM8 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pnma8aQ80VM8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Pnma8aQ80VM8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pnma8aQ80VM8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Pnma8aQ80VM8 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Pnma8aQ80VM8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Pnma8aQ80VM8 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnma8aQ80VM8 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnma8aQ80VM8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Pnma8aQ80VM8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Pnma8aQ80VM8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Pnma8aQ80VM8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Pnma8aQ80VM8 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Pnma8aQ80VM8 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms